在全面深化改革和国家治理能力现代化建设的背景下,行政公益诉讼这一新型常态化司法监督机制对我国国土资源主管部门依法行政提出了更高的要求。自开展行政公益诉讼试点工作以来,国土资源主管部门频频被诉的案例暴露了当前国土资源管理工作中存在的问题,想要提升国土资源管理能力和依法履职水平,则需要遵循善治政府构建的框架,对当前存在的问题进行分析,研究改进国土资源管理工作的方法。本文选取自试点阶段以来最高人民检察院公布的行政公益诉讼案例进行研究,并对涉及国土资源管理职能的行政公益诉讼进行归纳整理。在将行政公益诉讼案例分为国有土地出让、非法占地查处和矿产资源保护三类的基础上,综合运用案例分析法、访谈法和文献研究等方法,从案例中发现我国国土资源主管部门在依法履职上存在的问题。并从善治政府提出的责任性、法治等维度对存在问题进行剖析,总结出当前国土资源管理在法律制度建设、职能转变和监督机制方面存在的不足。为遵循善治政府构建的逻辑,应进一步提升国土资源管理的法治化水平、转变职能,并健全相应监督机制。随着绿色行政理念的发展,不仅需要在可持续发展理念下改革土地开发利用模式,还需要构建多元共治的土地治理体系。本文在行政公益诉讼这项新制度下,对现行国土资源管理理念、管理方式和政策措施提出一些改进的建议,以期更好地维护国土资源管理领域公共利益。