RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在喉癌中的表达及其临床意义分析

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目的喉癌是最常见的头颈部肿瘤之一,其分子机制仍未明确,因此,从分子水平上进行喉癌发生、发展机制的研究将为喉癌的诊治提供新的方向。最近的研究表明,lnc RNA在肿瘤发生、发展过程中扮演重要角色。既往有研究发现lnc RNA与头颈部肿瘤关系密切,但缺乏喉癌相关lnc RNA的研究,尤其喉癌相关的lnc RNA表达谱仍是空白。发现并鉴定与喉癌相关的lnc RNA对于提高我们对喉癌发病机制的认识将有重要的意义。本研究拟先揭示喉癌相关lnc RNA表达谱,并探索RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在喉癌中的表达及其临床意义。方法1.用基因芯片技术比较喉癌组织、癌旁正常组织中lnc RNA的表达谱,通过lnc RNA表达芯片,获得喉癌相关lnc RNA表达图谱并进行基因本体(Gene Ontology,GO)分析。2.采用实时定量逆转录-聚合酶链式反应(quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,q RT-PCR)检测87对喉癌患者的喉癌组织和癌旁正常组织、淋巴结组织中lnc RNA RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001的表达情况。3.通过克隆测序技术证实PCR产物中lnc RNA RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001的存在。4.分析lnc RNA RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001表达水平与喉癌患者临床病理因素、生存时间的关系,揭示其可能的临床意义。结果1.通过基因芯片分析喉癌相关lnc RNA表达谱,我们发现了684种lnc RNA在喉癌组织中表达上调差异>2倍,747种lnc RNA在喉癌组织中表达下调差异>2倍。2.RP11-169D4.1-001在芯片结果中表达上调5.26倍(P=0.002),AC026166.2-001在芯片表达谱中表达下调13.01倍(P=0.008)。3.RP11-169D4.1-001在喉癌组织中显著低表达(P<0.001),且在转移淋巴结中显著低表达(P<0.05)。伴随淋巴结转移患者RP11-169D4.1-001表达水平显著低于不伴淋巴结转移患者(P=0.007)。RP11-169D4.1-001在肿瘤组织中的表达水平和年龄、肿瘤位置、病理类型、吸烟史无显著相关性。4.与癌旁正常组织比较发现,AC026166.2-001在喉癌组织中显著低表达(P<0.05),且在转移淋巴结中显著低表达(P<0.001)。AC026166.2-001在肿瘤组织中的表达水平和年龄、肿瘤位置、病理类型、淋巴结转移、吸烟史无显著相关性。5.结合生存曲线分析,RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在肿瘤组织中的表达水平和生存时间相关(P<0.05)。结论本研究是国内外首个较系统研究喉鳞状细胞癌相关lnc RNA表达谱的研究。RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在喉癌发生发展过程中可能起重要作用,为喉癌的诊断和靶向治疗提供思路,并为喉鳞状细胞癌的预后判断提供新线索。
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