玉米大斑病菌Homeobox基因家族的全基因组鉴定与转录因子StSte12的关系研究

来源 :河北农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nnhdceh986532
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本实验室已经克隆了玉米大斑病菌Fus3/Kss l-homolog途径下游的转录因子基因StSTE12,生物信息学方法分析发现它具有转录因子所特有的STE homeodomain与ZnF_C2H2锌指结构,同时采用RNAi技术获得了StSTE12基因沉默转化子,进一步研究发现StSTE12基因在调控玉米大斑病菌附着胞发育及侵染过程中发挥重要作用,但是该基因调控的下游靶基因尚不明确。有研究发现:酵母中STE12基因可以通过调控Homeobox基因表达,然后由Homeobox基因产物再调控更多功能基因的表达来调节酵母的生长发育。本研究试图通过生物信息学方法分析出玉米大斑病菌基因组中Homeobox基因家族基因的数量、种类、基因及其编码蛋白的结构特点,采用Real-time PCR技术检测该家族基因在玉米大斑病野生型和StSTE12基因RNAi转化子中的表达水平,推测哪些基因可能受到StSte12的调控。主要研究结果如下:  1、生物信息学分析发现,玉米大斑病菌基因组中存在8个Homeobox家族基因,分别命名为StHTF1、StHTF2、StHTF3、StHTF、StHTF5、StHTF6、StHTF7和StHTF8。  2、Homeobox家族成员散布在玉米大斑病菌基因组的6个scaffold链上,多数基因位于DNA负链上;各基因均含有内含子,数量为1~3个;这8个基因所编码的蛋白质均含有保守的同源异型盒结构域(Homeodomain),且位于各个蛋白的不同位置。  3、从构建的系统发育树中可以发现:玉米大斑病菌的Homeodomain蛋白可以和其他真菌的Homeodomain蛋白聚类,表明不同真菌的Homeobox家族同源基因在氨基酸水平上呈现出高度的相似性。同时根据保守结构域分析,该家族基因可以分为4个类群。  4、通过预测Homeodomain蛋白的高级结构,可知该家族蛋白都具有螺旋—转角—螺旋(Helix-Turn-Helix)空间结构,与保守基序分析结果相符。  5、利用Real-time PCR技术,分析了玉米大斑病菌野生型菌株Homeobox家族基因在分生孢子萌发、附着胞发育以及侵染过程中的表达量变化情况,结果表明,在分生孢子萌发时期(3 hpi)、附着胞形成初期(6 hpi)、附着胞成熟时期(12 hpi)以及侵入丝形成时期(24 hpi),8个基因的表达都显著低于0h的表达水平(p<0.05)。说明Homeobox转录调控因子家族基因表达不利于病菌分生孢子萌发、附着胞发育以及随后的侵染过程。  6、采用Real-time PCR技术,检测了玉米大斑病菌野生型及StSTE12基因沉默转化子中Homeobox家族8个基因相对表达量变化,结果发现,在附着胞形成时期8个基因在转化子中的表达量均显著高于野生型。说明StSTE12基因沉默可解除对这8个基因表达的抑制。  7、以pBARKS1-GFP质粒为回复载体,构建了StSTE12基因的表达载体HF-StSTE12,转化野生型原生质体,利用草胺膦抗性及RT-PCR筛选初步得到了2株StSTE12基因的超表达转化子,为开展后续的CChIP试验奠定了基础。
其他文献
期刊
体轴发育抑制因子Axin是一种多功能构架蛋白,在多条信号传导途径中发挥重要作用:在Wnt信号通路中,Axin作为负调控因子,下调β-catenin的水平;在JNK信号通路中,Axin与MEKK1或MEKK4相
我国华南地区地属亚热带,是一个长夏无冬的地区,夏季炎热的高温常常导致冷却能耗的增加,提高生产成本;高浓度的初始糖发酵,使得菌体因为葡萄糖的分解代谢,阻遏葡萄糖氧化酶的合成,导
摘要:在教学过程中,教师的主导作用过强,而没有重视学生的主体作用,过于重视学生的体育学科成绩,对小学生身体全面发展和个性方面的发展没有引起足够的重视。这种教学模式和教学内容,会让小学生感到枯燥乏味,也会逐渐让小学生对体育课失去兴趣。让学生在学习中不断自我思考和创造,发挥自身的潜力。  关键词:体育教育;促进;主体地位;兴趣  中图分类号:G633.96 文献标识码:A 文章编号:1992-7711
流行病学和相关研究证实人乳头瘤病毒(HPV)感染与尖锐湿疣、宫颈上皮瘤样增生和宫颈癌的发生关系密切。其中,HPV6、11型是尖锐湿疣的主要致病因子,大约90%的生殖器疣与HPV6和HP
病毒诱导的基因沉默(Virus-induced gene silencing,VIGS)技术已在植物基因功能研究领域得到广泛应用。为了将烟草脆裂病毒(Tobacco rattle virus,TRV)介导的基因沉默技术应用于对大豆基因的功能研究,本试验建立了以TRV为载体介导的大豆基因瞬时沉默体系,并利用该体系对大豆中与大豆抗大豆花叶病毒(SMV)相关的胼胝质合酶基因(Gm Cal S7)和与大豆
在青藏高原东南缘,海拔高度3470m的尕海-则岔国家级自然保护区尕海保护站,研究了赭红尾鸲普通亚种(Phoenicurus ochruros rufientris)的繁殖。研究目的在于对赭红尾鸲繁殖期的行
摘要:数与形是数学中两个最基本的研究对象,数形结合就是把抽象的数量关系和直观的几何图形有机地结合起来。这主要包括两方面的内容:一是“以形助数”,即数量关系借助于图形及其性质使之直观化、形象化,從而获得解题方法;二是“用数解形”,即将几何图形的问题经过数量化描述,借助代数计算获得解题方法。  关键词:数形结合;以形助数;用数解解育  中图分类号:G633.6 文献标识码:A 文章编号:1992-77
期刊
本试验以云南黑山羊的Agouti基因序列为模板设计引物,利用黑白两种颜色的山羊基因组作为样品对Agouti基因部分序列进行扩增,获得了Agouti基因的部分序列。根据不同毛色山羊Ag