蛋白质组学是指在蛋白水平上对整个器官、细胞或组织的基因组所表达的全部蛋白质进行总体分析，更具体的说，是对特定细胞和组织在特定时间和条件下所表达的总蛋白的分析，且包括了各种蛋白的结构和功能。目前，蛋白质组学被认为是后基因组学时代研究中最活跃的学科领域之一，已广泛深入到生命科学和医药学的各个领域。蛋白质是各种生命活动的载体，而比较蛋白质组学则通过对不同样品蛋白质表达水平的比较，为电高辐射生物效应研究和辐射致癌机理研究带来了新的思维方式，它可以从组织或细胞蛋白质整体水平这一全新角度来研究电离辐射导致的生物免疫损伤。　　 本研究应用蛋白质组学原理和方法，以人T淋巴细胞白血病细胞株( Jurkat)为例，大量培养Jurkat细胞并以强度为4Gy对细胞进行X射线辐照，分别在照射后6h,12h，18h，24h，48h进行细胞收集，提取总蛋白。利用差异荧光电泳技术进行蛋白分离得到44个差异蛋白点，经过质谱分析和数据库检索，对其中的13个蛋白点进行了鉴定和分析。其中有部分蛋白点已经有研究证明，与T淋巴细胞的凋亡密切相关。本文通过研究电离辐射诱导T淋巴细胞损伤过程中蛋白质组的整体变化规律，为进一步阐明电离辐射诱导产生的损伤的作用机制奠定了基础。　　 同时，本研究采用纳升喷雾傅里叶变换回旋共振质谱仪研究了血管紧张素、缓激肽等标准肽段，在非持续共振碰撞诱导解离条件下的串联质谱行为，研究了其碎裂规律和特点。并对溶菌酶的胰蛋白酶水解肽段混合溶液进行了纳升喷雾傅里叶变换回旋共振质谱扫描，并对部分肽段进行了非持续共振碰撞诱导解离串联质谱研究，并对碎片进行了归属。这一方法实现了极少量蛋白的串联质谱研究，将所需的蛋白量降低到2～5个pmol，这对于样品来源珍贵，样品量稀少的蛋白来说，提供了更多的的质谱相关信息。