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目的:明确新疆头癣致病菌许兰毛癣菌、断发毛癣菌、紫色毛癣菌、犬小孢子菌4种菌的系统进化亲缘特征,试图从菌种演变进化角度为新疆头癣高流行的原因提供数据支持。方法:收集新疆医科大学第一附属医院皮肤科实验室保存的经形态学明确鉴定的头癣致病菌,分离的菌株患者分别来自北疆乌鲁木齐市和克拉玛依市,南疆喀什市及和田市。用于实验的临床菌株传代培养采用马铃薯PDA培养基27℃培养。提取已培养好的菌株基因组DNA,采用普通PCR扩增真菌通用引物ITS间区和Beta-tublin间区序列,凝胶电泳检测PCR产物送交测序,将所得数据在GenBank核酸数据库中进行blast同源序列比对。根据blast同源性比对结果,选取同源性程度最高的参照菌株信息,分别使用Clustal和MEGA5.0软件将序列匹配排列,进行500次bootstrap统计学检验,绘制四种菌的ITS和Beta-tubulin基因序列的系统进化树。结果:四种菌的ITS和Beta-tublin间区序列分子鉴定均与形态学鉴定完全吻合。使用Beta-tublin间区在真菌系统进化研究上比ITS间区更可靠,种间同源性达100%。根据系统进化树特征分析四种菌与参照菌株之间的亲缘关系,分别显示:新疆本地紫色毛癣菌与来自伊朗、日本、希腊和印度的紫色毛癣菌参考菌株聚集在一簇内,表明他们之间具有高度的亲缘关系,其中与来自伊朗的参考菌株KT192547.1的紫色毛癣菌距离最近,表明两者之间亲缘关系最近。犬小孢子菌株与来自伊朗、越南、新西兰、艾欧尼亚和印度菌株归属在一个主分之内,表明它们之间具有高度的亲缘关系,其中本地菌株与来自印度的参考菌株KU496912.1距离最近,表明两者之间亲缘关系最近。许兰毛癣菌与来源于伊朗、俄罗斯、澳大利亚、中国的参考菌株聚集在同一簇内,表明这些菌株之间具有亲缘性,但是本地菌株与参考菌株之间的亲缘距离均较远,表明本地菌株与参考菌株之间存在一定的区别。断发毛癣菌同来自印度、英国、日本、伊朗、越南的参考菌株聚集在同一簇内,表明他们之间具有亲缘性,但同许兰毛癣菌一样,新疆本地断发毛癣菌与这些参考菌株的亲缘关系距离均较远,提示本地菌与参考菌株之间存在一定的差别。结论:四种新疆头癣致病菌分别于来自不同地域的参考菌株之间具有亲缘性,其中本地紫色毛癣菌与来自伊朗菌株的亲缘关系最近;犬小孢子菌与来自印度的菌株亲缘关系最近;虽然许兰毛癣菌与同种属参考菌株具有亲缘关系,但亲缘关系较为疏远,表明与其他参考菌株之间存在一定的差异,断发毛癣菌也显示同样的系统进化特征。