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多毛类是环节动物门最大的一个纲,广泛分布在海洋环境中,是海洋底栖生物的重要组成部分。多毛类不仅在维持海洋底栖生态系统的正常运转上有举足轻重的地位,还在渔业养殖、鱼病防治和水域环境监测中有重要作用,但是多毛类丰富的多样性和复杂的生活史导致传统分类的混乱和相关研究的贫乏,分子系统发育学的兴起为多毛类分类学研究提供了全新的思路。本研究应用分子系统发育学方法,以18S rDNA和线粒体细胞色素C氧化酶亚单位Ⅰ(COⅠ)基因序列片段为分子标记,结合形态学特征对近岸的大中型多毛类和2003年“大洋一号”远洋科学考察船DY105-12/14航次、2005年“大洋一号”DY105-17航次采集的中国多金属结核合同区的多毛类样品的分类地位进行探讨。主要研究结果如下:1、对GenBank公布的应用在多毛类分子系统发育学研究的基因序列进行比较全面的统计和分析。结果显示,近年来线粒体基因序列片断异军突起,占统计总数的63.7%,各种功能性蛋白的mRNA序列也比较急速增长;rDNA基因是多毛类系统发育研究运用最普遍的系统发育分子标记,大约占总数的33.7%。统计过程还让我们了解多毛类各类群的基因序列分布情况,收集各种分子标记的信息、摸索它们的进化规律,这样我们就可以比较清楚地了解多毛类系统发育研究的最新动向,并选择适合的分子标记。2、以近岸大中型多毛类样品为实验材料,摸索出一套从70%的乙醇溶液固定的大洋微小型样品中提取DNA的方法,并比较了不同保存方法对分子学研究的影响,结果显示70%乙醇溶液保存的样品能提出比较理想的DNA模板。3、顺利扩增了六种近岸多毛类的18S rDNA和COⅠ基因序列片段,并且成功地扩增了大洋小型底栖生物样品的18S rDNA序列片断。从GenBank检索的相关序列,结合我们测得的序列,构建了基于18S rDNA的系统发育树,并结合形态学特征,对样品作比较明确的系统发育定位。4、在对序列比对过程中,发现鳞沙蚕亚目的多鳞虫科、蠕鳞虫科、锡鳞虫科、金扇虫科的多毛类的18S rDNA序列片断,在大约第720-800个碱基处有一段大约80bp的序列是它们独有的,其它多毛类均不同程度地缺失。这个结果是我们首次报道的,目前尚未见其他相关的报道。