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土壤盐渍化是世界范围内影响农业生产的主要非生物胁迫因素,盐胁迫对植物生长发育存在显著影响。小麦是盐碱化土壤的主要栽培作物之一,对于盐碱地的改造治理及其利用方面具有突出作用。因此,筛选利用优异耐盐碱种质资源以及挖掘优异耐盐抗盐基因,对于盐碱地的改造利用、提高盐碱地农业生产水平具有重要作用。本研究以黄淮麦区近期育成的125个小麦品种(系)为材料,设置3个NaCl浓度梯度(分别为T1:0 mM(CK)、T2:75 mM和T3:150 mM NaCl),进行了苗期水培试验,调查了苗高、根长、根数、根系鲜重、苗部鲜重、根系干重、苗部干重、植株总干重、鲜重生物量根冠比、干重生物量根冠比等10个性状。利用90 K SNP芯片筛选得到的9329个SNP位点,对小麦苗期耐盐相关性状进行全基因组关联分析,以期找到与耐盐性相关的显著关联位点,为进一步进行小麦耐盐性分子标记辅助选择和相关基因的分离提供参考。主要结果如下:(1)表型变异分析表明,10个性状在6个环境—处理下表现较大的变异,变异系数范围是10.69%(E2T3)~49.82%(E1T3),所有10个性状均表现出连续变异。方差分析表明,所有性状基因型间存在显著差异,所调查性状的遗传力均超过65%,变化范围为65.54%(干重根冠比)~83.03%(株高)。耐盐指数也表型了较大的变异,范围为8.79%(苗高)~35.62(根系干重)。相关性分析发现,多数性状见呈显著正相关。(2)共检测到268个QTL与小麦苗期耐盐性状及耐盐指数显著关联,包括了292个SNP标记,其中247个标记已有遗传位置信息,45个标记没有位置信息,显著关联标记的表型变异解释率范围为8.95-26.84%,分布在除3D和5D的另外19条染色体上。(3)共检测到108个RHF-QTL与小麦苗期耐盐相关性状显著关联,包含174个SNP标记,其中24个SNP标记没有具体的遗传位置信息,150个SNP标记已定位遗传位置信息,表型变异解释率范围为8.95%-26.84%,分布在除3D、5D、6D和7D的其余17条染色体上,其中1B染色体所包含标记最多,为40个,其次为7B染色体,为17个。(4)共检测到119个RHF-QTL与小麦苗期耐盐指数显著关联,包含203个SNP标记,其中31个SNP标记没有具体的遗传位置信息,172个SNP标记已定位遗传位置信息,表型变异解释率范围为9.15%-24.84%,分布在除3D、5D和7D的其余18条染色体上,其中1B染色体所包含标记最多,为37个,其次为3B染色体20个。(5)本研究共检测到26个QTL簇,分布在1A、1B、1D、2A、2B、3A、3B、4A、5A、6B、7A和7B这12条染色体上,包含了93个QTL;其中有2个QTL簇没有定位到染色体上,包含了8个QTL。