地衣芽孢杆菌海因氧化酶基因的克隆及表达研究

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以本实验室保存的一株地衣芽孢杆菌MR1229的染色体DNA为模板,设计一对引物,通过PCR方法,获得一段与Bacillus lichenformis ATCC14580中Hydantoin utilization protein A的特异性扩增主带。分离纯化后,与pGM-T载体通过T4 DNA连接酶平端连接,高频转化法转化大肠杆菌(E.coli)JM109。经α-互补实验筛选出阳性菌落,通过对重组菌株的质粒分离纯化,限制性酶PstⅠ单酶消化,测序等一系列鉴定实验,表明重组质粒pMH-2中含有地衣芽孢杆菌Hydantoin utilization protein A的PCR扩增片段。我们将克隆到的基因片段命名为海因氧化酶(HyuO)。将HyuO进行测序,测序后的序列在NCBI的GenBank中搜索,采用Blast、ClustalW软件进行核苷酸序列、氨基酸序列分析及同源性比较。结果表明HyuO全长2106bp,编码701个氨基酸,G+C含量为49.85%,理论分子量为76.7KD,理论等电点为5.24,其中疏水性氨基酸占46.6%。将HyuO核苷酸序列与Bacillus lichenformis ATCC14580中Hydantoin utilization protein A核苷酸序列比对,发现有7个核苷酸发生改变,其中5个核苷酸发生转换,2个核苷酸发生颠换,两个序列相似性达99%;将HyuO氨基酸序列与Bacillus lichenformis ATCC14580中hypothetical protein BLio1982氨基酸序列比对,有三个氨基酸发生改变,一处由苯丙氨酸变为亮氨酸,一处由苏氨酸变为异亮氨酸,一处由丝氨酸变为苏氨酸,两序列同源性为99%。根据NCBI上保守区预测,HyuO含有一个完整的海因氧化酶。其中含有三个功能区域:第一个区域为第9-188个氨基酸(HydanAN),该区域为海因酶/氧脯氨酸酶的N-末端区域;第二个区域为第209-494个氨基酸(HydantoinaseA),海因酶/氧脯氨酸酶,这个家族包含海因酶和氧脯氨酸酶(EC 3.5.2.9),所有的反应是通过内部的酰亚胺水解而引起的5-元环的水解;第三个区域为第6-687个氨基酸(HyuA),N-甲脲乙醇酸酐天门冬氨酰酶A/丙酮羧化酶,β-亚基,参与氨基酸转运和代谢、次级代谢产物的转运和分解。利用生物信息学对HyuO氨基酸进行结构分析及功能预测,结果表明在160-170位,470-480位氨基酸处有两个较明显的疏水性区域;在第55、510和第570个氨基酸处有较强的形成α螺旋的倾向,在第170、330和380个氨基酸处有较强的形成β折叠片的倾向,有随机螺旋结构;在第510-530个氨基酸处有卷曲螺旋出现;HyuO基因无N端信号肽,不形成跨膜结构。
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