【摘 要】
:
本研究主要目的为建立携带与未携带松材线虫Bursaphelenchus xylophilus的松墨天牛Monochamus alternatus成虫各组织的转录组数据库,用以揭示松墨天牛对松材线虫响应的转录组表达特征。以携带和未携带松材线虫的松墨天牛成虫的气管、表皮和脂肪体为材料,采用Illumina Hiseq TM2000测序平台开展松材线虫的转录组测序,利用Trinity软件对RNA-Seq
【基金项目】
:
中国科学院前沿科学重点研究项目(QYZDB-SSW-SMC014); 国家自然科学基金项目(31572272);
论文部分内容阅读
本研究主要目的为建立携带与未携带松材线虫Bursaphelenchus xylophilus的松墨天牛Monochamus alternatus成虫各组织的转录组数据库,用以揭示松墨天牛对松材线虫响应的转录组表达特征。以携带和未携带松材线虫的松墨天牛成虫的气管、表皮和脂肪体为材料,采用Illumina Hiseq TM2000测序平台开展松材线虫的转录组测序,利用Trinity软件对RNA-Seq数据进行从头组装,利用NCBI数据库进行基因注释。通过DEG-Seq分析携带和未携带松材线虫的松墨天牛成虫的差异表达基因,对上调表达基因进行GO和KEGG代谢途径富集分析,并通过实时定量PCR技术对压力胁迫响应,体液免疫中的抗菌肽与黑化作用相关基因的表达水平进行验证。测序过滤后共获得55 059条单基因簇(unigene),平均长度为1 536 bp。将unigene与数据库中的序列进行BLASTX比对,成功注释24 354条unigenes,其中4 022条unigene在GO数据库中获得注释,6 098条unigene在KEGG数据库中获得注释;经过GO与KEGG富集分析显示,松墨天牛成虫携带松材线虫后,差异表达基因主要为与其气管中压力调节、组织与DNA修复、激素响应方面相关的基因;实时定量PCR分析结果显示与压力胁迫相关基因的表达量在携带松材线虫的松墨天牛气管中相比未携带松材线虫的松墨天牛气管中的显著上调,而体液免疫中的抗菌肽及黑化反应相关的基因则整体呈下降趋势。本研究初步阐明松墨天牛携带松材线虫后压力胁迫相关基因上调而相关面议反应相关基因整体呈下降趋势的基因表达模型,为进一步研究松墨天牛的基因功能及对松材线虫的胁迫响应过程,深入研究松墨天牛能够携带松材线虫的机制奠定基础,为防控松材线虫病提供了新的参考方向。
其他文献
校本课程特有的开放性为融合STEAM理念提供了实践土壤,本文以校本拓展类课程"厨房里的化学"为例,从优化课程的设计、实施等方面提出实践策略。课程以化学知识为设计主干,融合工程、技术等多个学科,跨越学科界限进行以活动为载体的整合,将科学与生活紧密联系,在改变学生学习方式方面进行积极尝试,为同类校本课程的开发提供可行性借鉴。
近年来,四川省彭州市精神卫生工作始终坚持"预防为主、防治结合、重点干预、广泛覆盖、依法管理"的原则,建立"政府领导、部门合作、社会参与"的工作机制,努力提升全民精神卫生和心理健康意识,取得良好成效。新冠肺炎疫情期间,彭州市大力开展新冠肺炎疫情相关的心理健康知识宣教,派出一名心理治疗师加入四川省第十批援湖北心理救援医疗队赴武汉参与心理救援,心理危机干预热线经成都市纳入5条防控新冠病毒感染的肺炎
母乳是婴儿营养的"黄金标准",婴儿配方奶粉是母乳不足时的替代品,对比分析母乳和婴儿配方奶粉的渗透压及婴儿配方乳溶液的渗透压影响因素,包括分析冲调方式(推荐质量和推荐匙量冲调)和婴儿配方奶粉的配方和工艺对婴儿配方奶粉溶液渗透压的影响。结果表明,母乳渗透压在300 mOsm/kg H2O左右,普通配方奶粉在严格按照推荐质量冲调的渗透压在281~325 Osm/kg H2O,该条件不会让婴儿有受高渗透压
GPS可以适用于全球大部分地区的定位,但在室内或太空高轨道等特殊条件下,不经过一定的算法处理,GPS是无法实现有效的定位的。基于此,本文将研究GPS接收机的射频前端硬件设计与弱信号条件下的捕获算法,即高灵敏度捕获算法研究。高灵敏度接收机的算法处理主要分为捕获、跟踪、定位解算三个模块。捕获是中频算法处理的第一步,能否捕获到信号至关重要。本文主要做了两方面的工作:GPS硬件接收机的射频前端设计和软件接
绵羊为适应寒冷而漫长的冬季,经过长期的适应性选择形成了较为丰富的皮下脂肪组织。然而,过多的皮下脂肪沉积降低了饲料利用率和羊肉品质。Micro RNA(miRNA)是一类内源性的短链非编码RNA,通常与其靶基因m RNA的3’-UTR结合,在转录后水平上降解m RNA或者抑制m RNA的翻译。此前研究报道,在遗传上缺失miR-33的小鼠可引起白色脂肪组织中前体脂肪细胞的数量增加、对脂质的摄取增加以及
浅层黄土不同植被覆盖方式下的温度和湿度变化对旱作农业作物选育、植株生长状态、作物产量和质量等都有重要影响。为了得到浅层黄土不同植被覆盖方式下的温度及湿度的变化规律,对浅层黄土在不同植被覆盖条件下温度及湿度变化进行了试验研究,在此基础上利用Origin软件进行函数拟合,通过CFD方法进行数值模拟的检验,得到温度及湿度的相关变化规律和模型。研究结果如下:(1)春季不同深度土壤的温度大小为5cm<15c