【摘 要】
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杨树溃疡病由葡萄座腔菌(Botryosphaeria dothidea)侵染所致,该真菌是一类世界性分布的真菌,寄主范围十分广泛,可危害多种林木和果树的树干及果实。本文通过Solexa高通量测序
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杨树溃疡病由葡萄座腔菌(Botryosphaeria dothidea)侵染所致,该真菌是一类世界性分布的真菌,寄主范围十分广泛,可危害多种林木和果树的树干及果实。本文通过Solexa高通量测序来自感溃疡病和未感病毛白杨的两个RNA文库,经过De novo拼接获得了339283个转录本。对于获得的基因进行了富集分析和差异表达分析,并从1niRNA靶基因角度对转录组中的靶基因功能进行生物信息学分析。研究结果为挖掘与响应溃疡病相关的候选基因奠定了基础。主要结果如下：(1)本实验2个毛白杨转录组共有71629个unigenes注释上了64个GO terms,通过KEGG功能注释得到33304个unigenes,映射得到319个功能代谢调控网络。(2)经过差异表达分析,发现206586个差异表达的转录本。在富集分析中,能量代谢和氧化还原相关的大分子在KEGG通路中大量富集,显示了植物体响应真菌的动态防御过程。谷胱甘肽S-转移酶(Glutathione S-transferase, GST)等基因在毛白杨感染溃疡病后显示高水平的表达,推测其为毛白杨抵御溃疡病菌的关键基因。(3)通过靶基因预测软件psRNATarget,以已知的毛果杨miRNAs为探针,寻找其在毛白杨感染溃疡病转录组中的靶基因,找到347个miRNAs的772个靶基因,分别编码与植物激素信号传导、植物病原互作、谷胱甘肽代谢等与植物抗病密切相关的蛋白。
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