【摘 要】
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目的:肝癌由于其发病隐匿,多数病例在诊断时即为中晚期,其五年生存率低于20%。RBPs在肝癌中通过多种机制参与肝癌的发生,并对肝癌患者预后产生重要作用。因此,本研究旨在运用RBPs构建肝癌预后评估模型用于评估肝癌患者的预后。方法:从TCGA数据库及ICGC数据库下载肝癌及正常肝组织表达谱数据及临床数据,通过差异分析筛选差异表达的RBPs,进行GO、KEGG富集分析探索差异RBPs在肝癌中的功能,构
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目的:肝癌由于其发病隐匿,多数病例在诊断时即为中晚期,其五年生存率低于20%。RBPs在肝癌中通过多种机制参与肝癌的发生,并对肝癌患者预后产生重要作用。因此,本研究旨在运用RBPs构建肝癌预后评估模型用于评估肝癌患者的预后。方法:从TCGA数据库及ICGC数据库下载肝癌及正常肝组织表达谱数据及临床数据,通过差异分析筛选差异表达的RBPs,进行GO、KEGG富集分析探索差异RBPs在肝癌中的功能,构建PPI网络并筛选其中的hub基因,Cox比例风险回归分析筛选肝癌预后相关RBPs并用于构建肝癌预后模型,并对模型有效性进行验证。结果:差异分析得到差异表达的RBPs共有135个,其中高表达的有113个,低表达的有22个。通路富集分析提示差异RBPs主要富集到RNA代谢调控(RNA剪接、RNA降解和RNA转运等)、DNA甲基化等过程。PPI网络中的6个hub基因在肝癌的发病中发挥重要作用。DCAF13、PURG、ADAD1以及EZH2四个关键基因与肝癌的预后密切相关,并用于构建肝癌预后模型。风险评分可以作为肝癌的独立预后因子。结论:DCAF13、PURG、ADAD1以及EZH2在肝癌中显著高表达,与肝癌预后密切相关,高表达患者具有较差预后。基于DCAF13、PURG、ADAD1以及EZH2四个关键基因构建的肝癌预后评估模型,有助于肝癌的预后评估,指导临床决策和治疗。临床分期、T分期以及风险评分与肝癌患者的预后显著相关,且风险评分可以作为肝癌预后的独立预后因子。
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