【摘 要】
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第一部分 生物信息学辅助克隆并分析人肾脏能量代谢相关基因hSDCT2 为了探讨能量代谢相关基因hSDCT2(human sodium-dependent dicarboxylate co-transporter,人高亲和力Na
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第一部分 生物信息学辅助克隆并分析人肾脏能量代谢相关基因hSDCT2 为了探讨能量代谢相关基因hSDCT2(human sodium-dependent dicarboxylate co-transporter,人高亲和力Na~+依赖性二羧酸转运蛋白)在人体内的生理功能及其与疾病的关系,借助生物信息学技术成功地从人肾中克隆了hSDCT2基因。首先将大鼠SDCT2 cDNA与人EST数据库进行同源性比较,获得具有高度同源性的EST片段并用DNAstar软件将它们拼接成EST重叠群,然后在重叠群上设计PCR引物从人肾总RNA中用RT-PCR扩增出hSDCT2基因并用网上分子生物学软件对其结构特性、组织分布及基因定位进行分析。序列测定结果显示hSDCT2开放阅读框为1809bp,共编码602个氨基酸。蛋白同源性分析表明其氨基酸序列与大鼠及小鼠SDCT2分别有85%和87%相同。二级结构预测显示该蛋白有12个跨膜螺旋区。该基因可在肾、肝、脑、胎盘、肺、中枢神经系统以及胃肠等十多种组织中表达,并定位于20号染色体的q12-q13.1。上述研究提示借助生物信息学方法进行网上基因克隆及功能分析是一种简便快速的途径。
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