深部真菌感染的发病率随着免疫受损人群的不断增多呈逐渐上升趋势，已经成为院内感染死亡的主要原因之一。近年来病原菌也发生了菌谱演变，临床上不断出现新型的真菌感染。因此，快速、敏感、特异地鉴定病原菌对于临床真菌感染的诊断和治疗具有重要的意义。本研究根据真菌翻译延伸因子序列设计种、属特异性引物，或根据全基因组序列设计微卫星引物，以复合PCR、微卫星技术，探讨病原真菌的快速、敏感、特异的鉴定、诊断技术。利用翻译延伸因子基因属特异引物组合(念珠菌属、曲霉属、隐球菌属组合或曲霉属、毛霉属、镰刀菌属组合)，进行多重PCR均扩增获得属特异性条带。且多重PCR反应可检测出100fg的真菌DNA。因而具有很好的特异性和敏感性。用属特异引物与白色念珠菌种特异引物组合，可获得白色念珠菌种特异条带(537bp)。根据基因库中已公布的真菌全基因序列设计了四种单一微卫星核心序列引物，利用正交设计优化了反应体系。对烟曲霉可扩增出2～5条带，分子量约在360～1960bp之间。不同引物对烟曲霉的扩增结果有明显差异，而同一种引物可获得清晰的特异性带型。这四种引物对烟曲霉的鉴定均具有种特异性。实验具有良好的重复性和稳定性。通过本研究建立了主要病原真菌的快速、敏感、特异的鉴定、诊断技术，为临床真菌感染的诊治、预防、流行病学、疾病发生发展规律等研究提供有力的科学依据和技术支撑。