灰霉菌(Botrytis cinerea)是危害番茄产量并在世界范围内造成巨大经济损失的主要病原菌之一。源自茄科的mi R6024可以通过靶向R基因和介导其靶基因产生phasi RNAs参与对番茄、马铃薯和烟草等生物胁迫的反应。然而,mi R6024是否能够在番茄中响应灰霉菌的侵染尚不明确。本研究发现mi R6024在灰霉菌感染番茄的早期迅速下调,并且其含量保持在一个很低的水平。通过ps RNAtarget预测mi R6024在番茄中的靶基因,我们发现这些靶基因中有6个R蛋白编码基因在灰霉菌侵染的番茄叶片中显着上调,与mi R6024呈负相关。此外,mi R6024在番茄中可以靶向Solyc05g008070产生5个高丰度phasi RNAs,这些phasi RNAs在灰霉菌处理的番茄叶片中也呈现下调趋势,与mi R6024呈正相关。我们还发现,phasi RNA Solyc05g008070＿D22(-)能够靶向天冬氨酰-t RNA连接酶的编码基因,这个靶基因在灰霉菌感染的番茄叶片中呈上调趋势,与Solyc05g008070＿D22(-)呈负相关。我们对番茄中的mi R6024及其靶基因Solyc05g008070进行了烟草中的瞬时过表达和拟南芥中的稳定过表达,结果表明mi R6024的过表达增加了烟草和拟南芥对灰霉病菌的易感性。综上所述,sly-mi R6024在番茄中可以通过抑制R蛋白和天冬氨酰-t RNA连接酶编码基因的活性来降低番茄对灰霉菌的抗病性,在拟南芥中可以通过靶向氨酰-t RNA连接酶编码基因来增加拟南芥对于灰霉菌的易感性。