用于提高超分辨定位显微成像空间分辨率的数据处理方法研究

来源 :华中科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:donnastinsbt
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
超分辨定位显微成像将荧光显微成像的空间分辨率提高了超过一个数量级,使生命科学领域的研究者可以从分子水平观测生物精细结构与功能。为了提升该方法的测量精确度,拓宽该技术的应用范围,需要研究进一步提高超分辨定位显微成像空间分辨率的方法。其中,提升超分辨定位成像数据处理方法的精度是提高该技术空间分辨率的直接、有效手段。本文通过分析超分辨定位成像中的关键数据处理步骤,并针对提升数据处理精度所遇到的难点,从高密度分子定位、漂移校正、分子筛选以及图像可视化方面进行了研究:(1)高精度快速高密度分子定位方法。本文分析了限制当前高密度定位方法计算性能的瓶颈,通过优化初始模型预估与多分子拟合的非凸优化问题求解,开发了高精度、少计算量的高密度分子定位方法PALMER (PArallel Localization of Multiple Emitters via Bayesian information criterion Recommendation),并基于ImageJ图像处理软件开发了此方法的实用性插件,解决了当前高密度分子定位算法无法兼容快速与高精度性能的问题。通过仿真与实验验证,证实PALMER方法具有高的定位精度与分子检测率,且定位速度比著名的高密度定位算法DAOSTORM快一个数量级。比起常规的稀疏分子数据采集与定位,通过高密度分子采集与PALMER方法的结合,可以将奈奎斯特空间分辨率提升近四倍。(2)高精度漂移校正方法。本文深入分析了互相关漂移校正方法的数学模型,并利用定位数据集中不同时间的子数据集均描述同一目标结构的冗余性特征,开发了基于冗余互相关计算的漂移校正方法(Redundant Cross Correlation, RCC)。仿真与实验验证的结果显示,RCC算法具有高精度、高鲁棒性的特点。RCC方法一方面可以在处理此前互相关漂移校正方法不适用的低信号数据集时,获得纳米量级的高精度校正结果;另一方面还可以提升超分辨重建图像的有效空间分辨率:相比其他的互相关漂移校正方法,RCC算法将空间分辨率提升了约10%。(3)高性能分子筛选以及图像可视化方法。本文基于拓展定位数据集有效数据维度的基本思想,利用对目标结构的先验知识从定位数据集中提取结构各向异性特征,开发了基于各向异性系数的分子筛选方法。仿真与实验数据分析结果显示,该分子筛选方法可以有效滤除定位数据集中的背景噪声,包括其他方法所不能滤除的非特异性簇状聚合杂点,从而显著提高定位数据集的信噪比。同时,本文讨论了各向异性特征可以与高斯渲染图像可视化方法相结合,用于非线性地增强超分辨重建图像中的空间结构信息。综上,本文利用超分辨定位显微成像的固有特征,发展了一系列高精度的数据处理方法,进一步提高了超分辨定位显微成像的空间分辨率,有望促进超分辨定位显微成像在精细结构与功能解析中的应用。
其他文献
提出以软固结磨粒群(Softness consolidation abrasives,SCA)气压砂轮为工具的加工方法,对磨粒群密集颗粒系统的力学特性进行分析,用于解决激光强化后局部高硬度区域难以高效光
为适应现代企业对工程型人才的新要求,河海大学机电工程学院以学生工程实践创新能力的培养为主线,结合机械原理的教学特点,对机械原理课程实验教学存在的问题进行了探索和改
违法分包及非法转包是建筑工程发包和承包的涉及的主要问题,我国《建筑法》、《合同法》及《建设工程质量管理条例》等法律法规对于工程分包和转包明确规定了适用的原则和效
自2008年以来韩国实施了长期护理保险制度,内容涵盖了广泛的老人服务,从日常饮食起居到专业护理。这一制度的设立对中国发展家庭照顾和护理员制度具有借鉴意义。本研究回顾了
<正>壹舍设计创建于2009年,是集室内设计、环境设计、软装设计等一体化的综合性专业设计公司,主要从事商业空间、办公空间、高端楼盘样板间、高档别墅、精品酒店等设计项目。
目的:探讨导致血液标本检验不合格的原因及预防措施。方法:对2014年1月~2015年1月期间在我院检验科进行检验的1200例血液标本进行回顾性分析。我院统计出这1200例血液标本中
为了解决教学中学生对三极管微变等效电路的疑惑,有必要从理论上对微变等效电路进行分析,从而消除学生的疑惑;为学习模拟电子打下良好理论基础;文章从偏微分方程出发,结合电路网络
中国工程院院士、清华大学机械工程系教授柳百成在2016(第四届)先进制造业大会上表示,关于中国智能制造,工业技术一定要强,把智能制造作为突破口。但这个事情并不是一蹴而就的。对
食用植物油脂是脂肪酸甘油三酯的混合物,精制大豆油是我国居民主要食用植物油脂之一,烟点与游离脂肪酸含量是精制大豆油的两项重要质量指标,其直接决定了大豆油的质量等级。一般
针对网球上手发球技术特征和教学特点,对普通高校网球上手发球技术教学课采用“分组合作教学法”并进行了有针对性的对比实验,实验结果表明:在网球上手发球技术教学中运用“分组