随着组合化学技术以及高通量活性测定技术的飞速发展,小分子结构与生物活性数据呈现出爆炸式增长趋势。然而,对于不同实验条件下测定出的生物活性数据,仍然缺乏有效的数据整合与分析方法。例如传统定量构效关系(Quantitative Structure-Activity Relationship,QSAR)通常局限于相同或相近实验条件下,针对同一生物靶标而进行的结构-活性关系研究,从而导致其应用范围受到很大制约。因此,对于这些来源和检测方法不同的生物活性数据,如何有效分析并加以运用,从而指导生物学、化学以及药学等领域的理论与实验研究,已经成为亟待解决的关键问题。微扰理论(Perturbation Theory,PT)是指将一个复杂问题分解为接近真实问题的“可解”部分和微小“扰动”部分的加和,是寻求一个复杂问题近似解的数学方法。在PT与QSAR理论方法指引下,论文基于面向对象编程思想,在J2EE体系结构和技术规范下,采用MVC(Model-View-Controller)Web开发模式,结合开源框架Struts2及MySQL数据库,构建基于微扰理论的药物活性定量预测平台(PT-QSAR)。经开发环境搭建、系统需求分析、系统总体设计、系统实现等关键环节,成功构建了可满足用户主要需求的PT-QSAR预测平台,可实现数据预处理、变量筛选、定量构效关系建模、模型验证与评价、结果与分析等主要功能。在此基础上,利用该平台对组胺H3受体抑制剂、碳酸酐酶Ⅳ抑制剂以及腺苷A1受体拮抗剂进行了实例研究。研究结果显示:PT-QSAR平台可有效解决不同实验材料或条件下的数据整合和利用难题,且取得优于传统QSAR方法的预测性能,因此有望在生物活性数据整合与利用以及转化医学研究领域得到更为广泛的应用。