鲈鱼SNARE基因的克隆与序列分析

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SNARE蛋白家族是参与细胞内膜运转和细胞胞吐与分泌作用的关键蛋白.利用核酸序列数据库(GenBank)中SNARE蛋白相关基因的保守序列,设计出基因特异性引物,从鲈鱼脑组织总RNA中逆转录扩增(RT-PCR)出SNARE蛋白家族核心成员SNAP-25,VAMP2和Syntaxinl的部分cDNA序列.在此结果的基础上再次设计引物,通过cDNA末端快速扩增法(RACE),进一步获得基因末端未知部分的序列信息.最终得到SNAP-25基因全长序列,VAMP2基因80﹪的序列和SyntaixnlA基因50﹪的序列.借助不同的网络服务器和生物学软件,通过对鲈鱼SNAP-25基因进行同源性比较,蛋白质一级结构解析,二级结构预测等项分析,探讨了海洋硬骨鱼类SNARE蛋白的结构、相互关系和功能.
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