【摘 要】
：
热休克蛋白是生物体受到外界刺激时合成的一类蛋白质,具有分子伴侣、调节细胞凋亡和参与机体免疫等生物学功能,研究表明热休克蛋白与许多的疾病有一定相关性,而且热休克蛋白已成为特定药物的靶点,对疾病的治疗起到不可替代的作用。由于过度使用抗生素,人们担心随着抗生素耐药菌株的迅速增加,现有的抗生素将无法有效抵抗这些病原体。使用细胞壁裂解酶来消灭细菌已成为避免抗微生物剂耐药性危机的可行性选择。本文以热休克蛋白和
【基金项目】
：
内蒙古自治区自然科学基金项目（2019MS03015）；
论文部分内容阅读
热休克蛋白是生物体受到外界刺激时合成的一类蛋白质,具有分子伴侣、调节细胞凋亡和参与机体免疫等生物学功能,研究表明热休克蛋白与许多的疾病有一定相关性,而且热休克蛋白已成为特定药物的靶点,对疾病的治疗起到不可替代的作用。由于过度使用抗生素,人们担心随着抗生素耐药菌株的迅速增加,现有的抗生素将无法有效抵抗这些病原体。使用细胞壁裂解酶来消灭细菌已成为避免抗微生物剂耐药性危机的可行性选择。本文以热休克蛋白和细胞壁裂解酶为研究对象,数据集选择已发表论文中的基准数据集。特征参数选取:氨基酸单肽组分信息、分段氨基酸组分信息、氨基酸二肽组分信息、联合三联体特征、平均化学位移、位置特异性得分矩阵。预测算法选择:支持向量机、随机森林、k-最近邻、朴素贝叶斯。为克服数据集不平衡分类问题,使用合成少数类过采样技术来平衡数据集。对细胞壁裂解酶数据集,我们对其氨基酸二肽组分信息利用F-score进行冗余特征信息处理。对于热休克蛋白家族,将分段氨基酸组分信息、氨基酸二肽组分信息、联合三联体特征、平均化学位移四个特征组合,输入到支持向量机,经Jackknife检验和对数据集平衡处理,总体成功率达到99.72%,比选取相同组合特征而没有对数据集进行平衡处理的结果高出4.81%。与现有文献中其他方法相比,我们预测模型的HSP20、HSP40、HSP60、HSP70、HSP90和HSP100的Acc分别为99.93%、99.72%、99.93%、99.85%、100%、100%,比Pred HSP方法高出3.57%、7.81%、3.97%、7.98%、1.57%、2.52%;比ir-HSP方法高出3.65%、3.25%、3.32%、2.33%、0.83%、0.83%。对于细胞壁裂解酶,将氨基酸单肽组分信息、氨基酸二肽组分信息、位置特异性得分矩阵和平均化学位移四个特征组合,输入到支持向量机,经Jackknife检验和对数据集平衡处理,其敏感性,特异性,马修斯相关系数和预测成功率分别达到99.35%、99.02%、0.98、99.19%。与现有文献中其他方法相比,我们的预测成功率比Ding等人、Lypred、CWLy-SVM的预测方法分别提高18.79%、7.89%、3.69%。
其他文献
土壤盐渍化和干旱缺水是制约灌区农业可持续发展的重要因素,通过抬高暗管排水出口高度,控制排水可减少田间排水输出,提高水分利用效率。因此,在暗管自由排水基础上进行控制排水,对防治土壤盐渍化和缓解干旱压力具有重要意义。基于以上研究背景,本文选取暗管排水试验区,进行为期两年的试验监测,探讨土壤水盐分布与空间变异状况受排水方式的影响;讨论控制排水的节水控盐效果;利用HYDRUS-2D模型对比不同出口控制高度
灌溉淋洗盐分与暗管排水工程结合可显著提高脱盐效果。生物改良也是盐碱地的改良的主要措施,不同的耐盐作物对盐碱地的响应也不同。本研究在暗管排水条件下,施加不同的灌水量处理,探讨不同耐盐作物对盐碱地土壤水盐及土壤酸碱度的响应。共设计了3种灌溉处理,分别是无灌水对照处理（“1”）、节水灌溉处理（“2”）、传统灌溉处理（“3”）;分别选取油料向日葵（YK1、YK2、YK3）、高丹草（GD1、GD2、GD3）
为揭示植物根系的固土抗蚀机理作用,且在植被恢复和重建中可以为选择优良水土保持物种提供一定基础力学数据。本文以两种典型的水土保持草本植物沙打旺（Astragalus adsurgens）和紫花苜蓿（Medicago sativa）的根系作为研究对象,通过野外原位试验和室内模拟试验相结合的办法,进行单根拉伸试验、根土复合体剪切试验和根土界面摩阻试验,研究两种植物根系受拉受损后愈伤自修复的力学特性、瞬时
“蒙古族家具纹样”不仅继承和发展了蒙古族的千百年光辉文化,是蒙古族人民独特的艺术创造,更是一种融合了民族精神和思想情感的视觉艺术形态。蒙古族纹样种类多、图案混杂,有着厚重的线条和华丽的色彩,从它形成一直到现在,在各个时期都被广泛应用。人们获取到的信息绝大部分来自于视觉,而图像作为人们生活交流的重要载体,由于岁月变迁、气候变化等因素的影响,造成蒙古族家具纹样的模糊不清、边缘失真等问题,因此提高蒙古族
居室环境污染带来的健康隐患成为当下困扰人类的一大难题,负氧离子作为衡量空气质量的一个关键指标具有重要的现实意义。为缓解居室空气污染现状,提升空气质量,以人工林速生杨木为基材,在改善低密度、低强度与易皱缩变形等材性不足的同时赋予其更多样化的功能。本研究以内蒙古自治区特有矿产资源六环石为改性材料,采用真空浸渍技术及水热法,分别将六环石与二氧化钛引入木材,制备具有释放负氧离子功效的新型保健功能型木材,探
我国北方的河流以及一些大型调水工程在冬季会发生封冻现象。要想防治河冰引发的灾害,就要深入冰层内部掌握冰生长各阶段的特性。探地雷达作为一种先进的无损勘探技术,已经成功运用到冰层探测中。但在河冰领域,其仍然存在图谱解译困难、测量过程受时间空间限制大等问题。基于此,本文基于时域有限差分法建立冰层模型,进行正演模拟,建立常见冰下结构体的图像特征库。基于无人机载雷达技术,对黄河什四份子弯道冰层进行了探测,提
由于矿区煤矸石大量堆积占压土地和破坏原有植被,因此采取人工植被重建显得尤为重要,而人工植被重建效果的分析是评价生态修复和植被重建效果的重要环节。因此本文以毛乌素沙地宁东矿区枣泉煤矸石山人工重建的植被及土壤为研究对象,采用野外调查结合室内试验方法,对平台人工种植的侧柏乔木型、侧柏+柠条锦鸡儿+沙拐枣+冰草乔灌草混交型、柠条锦鸡儿+沙拐枣+糜子+波斯菊灌草型,边坡人工种植的黑沙蒿+柠条锦鸡儿+沙打旺、
戈壁是我国干旱区典型的荒漠景观地表,也是东亚主要沙尘源。风沙运动是干旱区地表过程的主要表现形式,在长期风沙作用下,戈壁地表景观在宏观上表现为均质的表面,但其地表沉积物组分、砾石盖度及分布形式存在明显的空间差异性,使得戈壁地表风沙运动呈现时间上“间歇性”和空间上“不连续”等特征。地表异质性制约戈壁风沙运动过程,同时风沙运动又显著影响戈壁地表沉积物组分的空间分布,能否定量化表达这种地表异质性并深入探究
以西鄂尔多斯保护区内荒漠灌丛为研究对象,使用点格局分析方法,研究该地区荒漠灌丛主要优势种的空间分布格局特征,并且通过分析优势种空间分布与环境因子的关系,进一步掌握优势种空间分布格局下环境因子的变化。结果表明:随着样地高程的变化,各优势种的空间分布格局由均匀分布向随机分布或聚集分布转变。霸王和沙冬青空间负关联,说明二者存在竞争;霸王和白刺空间无关联,表明二者不存在竞争;A、B和C样地内,霸王与四合木
植物叶片养分回收是多年生植物在养分贫瘠等逆境胁迫下重要的养分保存策略,研究荒漠植物的养分回收特征对理解荒漠生态系统的养分利用和养分循环有重要意义。本文以阿拉善盟吉兰泰盐湖周边4种不同立地类型下生长的荒漠植物为研究对象,通过野外调查及室内实验,对荒漠植物叶片的含水量、比叶面积、干物质量等7个叶片水分与功能性状指标,以及有机碳、N、P、K等7种养分元素回收特征进行测定,明确反映植物适应严酷环境的典型叶