随着科技经费投入的大幅增长,国家越来越重视科研经费管理,对科研经费的监管力度日趋加大。研究高校科研经费管理制度问题对于揭示我国高校科研经费管理行为的规律和本质、推动我国高校科研经费管理机制的完善与创新、促进我国高校科研经费管理的规范化及合理化进程、提升高校科研经费的使用效率等,具有一定的理论意义和重大实践意义。本文在借鉴相关理论与发达国家科研经费管理经验、综述国内外研究现状的基础上,运用案例研究、文献研究、比较研究等方法,论述A高校科研经费管理制度存在的问题,并剖析这些问题的根源,并且遵循A高校的科研经费管理制度的目标和原则前提下,设计出比较科学合理的科研经费管理制度,它包括科研经费管理组织结构设计、科研经费预算管理制度设计、科研经费核算制度设计、科研管理信息共享平台设计、科研经费管理监督评价制度设计。本文的研究目的在于优化A高校的科研经费管理模式,在会计核算上准确反映高校科研项目的实际运行状况,将高校科研经费管理扩展为事前、事中及事后的全面控制管理,从而提高高校科研经费使用效率,使其产生更好的社会效益和经济效益。