结球甘蓝(Brassica oleraceaL.var.capitata)简称甘蓝，是芸薹属的一种重要蔬菜，在我国各地广泛栽培。近年来，市场上的甘蓝品种不断增多，种植面积不断增大。但是，在种子市场上同名异物及同物异名的情况时有发生，甚至一些不合格种子混入市场，造成巨大的经济损失。因此，构建DNA指纹图谱，实现对品种的快速准确鉴定，对于假种辨别和产权纠纷具有重要作用。甘蓝是典型的异花授粉作物，杂种优势十分明显，通过选育自交系配制杂交组合是杂种优势利用的主要途径。而如何进行自交系间的组配，显得至关重要，目前主要依赖于育种家的经验及表型特征或地理来源，因此迫切需要从分子水平上初步划分甘蓝优势群，为育种家利用杂种优势提供科学指导，并提高组合配制效率。　　本研究对50份甘蓝自交系进行重测序，开发SNP标记。挑选一部分SNP标记转化为KASP标记，对主要甘蓝品种及自交系进行基因分型检测，根据分型数据构建主要甘蓝品种的DNA指纹图谱并划分甘蓝自交系的杂种优势群。主要研究结果如下:　　1.甘蓝全基因组KASP标记开发　　采用Illumina Hi-Seq2500平台对50个甘蓝高代自交系进行全基因组重测序，将重测序数据与参考基因组02-12进行比对，共筛选获得2.54×106个SNPs。在全部SNP中筛选多态性介于40％～60％、未测通材料数＜20、在9条染色体均匀分布、位点前后各50bp不存在其他变异，最终获得500个SNP位点。并将其转化为KASP标记，其中442个成功转化，转化成功率88.4％。在每条染色体中随机挑选1个标记，利用KASP平台对96个甘蓝自交系材料进行基因分型，9个标记全部分型成功。结果表明，开发的KASP标记的分型效果较好，可用于下一步试验。　　2.基于KASP标记构建甘蓝主要品种的DNA指纹图谱　　利用甘蓝全基因组开发的KASP标记，对59个主要甘蓝品种进行分型。在442个标记中，有25个标记的未分型材料数＞5，为保证结果准确性，在后续分析中将这25个标记去除。根据基因分型结果，筛选多态性信息含量＞0.35、无基因型数据缺失、在9条染色体上均匀分布的50个SNP位点作为核心标记，构建甘蓝品种指纹图谱。通过人工构建模拟群体进行验证，结果表明利用50个核心SNP标记构建的DNA指纹图谱可实现对甘蓝品种真实性和特异性的有效鉴定。　　3.利用KASP标记进行甘蓝自交系杂种优势群初步划分　　根据栽培茬口的不同，可将246个甘蓝自交系分为春甘蓝、秋甘蓝、越冬甘蓝三种类型。其中，春甘蓝包含77份材料，秋甘蓝包含72份材料，越冬甘蓝包含97份材料。基于甘蓝自交系的SNP标记分型结果，对不同栽培茬口的自交系进行遗传相似性分析及聚类分析，并结合系谱关系进行优势群的划分。结果显示，春甘蓝划分为7个优势群、秋甘蓝划分为6个优势群、越冬甘蓝划分为5个优势群。为验证杂种优势群划分的准确性，对上述部分自交系选配的50个优良杂交组合的双亲进行分析，除越冬甘蓝中‘嘉丽-绿×嘉丽-灰’组合为亚群内杂交外，剩余组合均为群间或亚群间杂交，这说明杂种优势群的划分较为合理。由此我们认为尽量选择群间或亚群间亲本材料进行组配，这将为杂交组合的科学配制提供依据，提高甘蓝杂种优势利用效率。