菜心非特异性脂转移蛋白基因(nsLTP)的克隆、表达与功能分析

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农田土壤中邻苯二甲酸酯(Phthalic acid ester,PAEs)的污染状况日趋严重,直接影响农产品质量安全,严重危害人体健康。课题组前期对筛选获得的高/低累积PAEs菜心(Brassica parachinensis L)进行转录组和蛋白组学分析,发现非特异性脂转移蛋白(nsLTP)基因在菜心高、低累积PAEs过程中差异表达十分显著。因此,为探讨nsLTP菜心在高/低累积PAEs差异特性形成中的作用,本研究通过RACE克隆获得了菜心nsLTP基因全长并对其进行序列分析,采用原核表达,亚细胞定位和分子模拟等实验手段研究其分子生理功能,为揭示不同基因型菜心高/低累积PAEs性状形成的分子生物学机制提供基础。本论文取得的主要研究结果如下:(1)本研究以菜心转录组数据为基础,经过RACE克隆获得了菜心nsLTP基因全长。该基因全长587 bp,开放阅读框(ORF)长297 bp。共编码97个氨基酸,蛋白分子量为10.36 KDa,根据蛋白质分子量分类,其属于nsLTP I型蛋白。通过基因序列比对分析发现与油菜(Brasscia nupus)nsTLP基因同源性最高,同源性高达97%,蛋白质多重比对以及进化树分析发现,与芜菁(Brasscia rapa)和油菜(Brasscia napus)差异最小,与芥蓝(Camelina sativa)差异最大。通过对蛋白氨基酸序列进行分析发现,该基因编码的蛋白质N端有一段29个氨基酸大小的信号肽,且具有与信号肽序列重叠的跨膜结构,对应的氨基酸序列疏水性明显。对菜心nsLTP蛋白二级结构和三级结构预测发现,nsLTP基因编码蛋白具有8个半胱氨酸组成4对二硫键而形成的疏水腔空穴。(2)成功构建pET-32a-nsLTP原核表达载体,在IPTG诱导下可在短时间内(3h)获得了大量重组蛋白。该蛋白为可溶性蛋白,低温及提高诱导剂浓度有利于重组蛋白可溶性表达。通过His标签纯化获得了重组蛋白,Western Blot验证显示获得的蛋白为目的重组蛋白。nsLTP基因原核表达及蛋白纯化为进一步研究nsLTP蛋白功能提供了基础。(3)成功构建了亚细胞定位载体pBI-121-GFP-nsLTP,并转化根癌农杆菌EHA105感受态细胞,侵染洋葱表皮细胞,通过激光共聚焦显微镜观察pBI-121-GFP-nsLTP融合蛋白绿色荧光信号在细胞中的分布情况。结果表明,GFP-nsLTP融合蛋白绿色荧光信号分布在细胞壁上,细胞核、细胞质、细胞膜中均未显示。为进一步确认融合蛋白荧光信号的分布,利用蔗糖溶液将洋葱细胞进行质壁分离,结果发现,原生质体明显皱缩,细胞质和细胞膜中无荧光信号,而细胞壁上发现了明显荧光信号,说明菜心中nsLTP蛋白定位在细胞壁上,与生物信息学预测结果一致。(4)利用分子模拟对DBP和nsLTP蛋白结合模拟分析,结果发现,DBP能紧密结合于nsLTP蛋白的H3和H5 α螺旋形成疏水性口袋中,并与H3 α螺旋上的半胱氨酸(Cys-37)通过氢键结合在一起,形成了 Cys-37:HN:DBP结构,键长为1.784 A。DBP分子被nsLTP蛋白分子中的Cys-65、Leu-36、Asn-64、Pro-63、Pro-34、Ser-62、Ala-61、Lys-33等氨基酯酸残基环绕。由于配体具有可旋转的原子,分子对接中的扭转能(Torsional Energy)为2.98 kcal/mol,配体和蛋白二者相互作用的分子间能量(Inermol Energy)为-7.44 kcal/mol,因此计算得到二者的结合能量(Binding Energy)为-4.46 kcal/mol(结合能=分子间能量+扭转能)。nsLTP蛋白能与DBP结合形成稳定复合物,在菜心吸收累积PAEs过程中具有重要作用。
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