CIB1基因在葡萄膜黑色素瘤诊断和预后中的作用研究

来源 :长江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:allviolet
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
恶性肿瘤是一种严重威胁人类健康的疾病,肿瘤的发生与防治研究仍将是生命科学研究的热点。眼科恶性肿瘤之一的葡萄膜黑色素瘤(Uveal Melanoma,UVM)是成年人中最多见的一种眼内恶性肿瘤,该病的发病率在国外、国内人的眼内肿瘤中分别占首位和次位,葡萄膜黑色素瘤极易经血液转移且致死率很高,易与多种眼底疾病相混淆,使得患者深受其害。关于UVM的治疗,目前以眼球切除为主要手段,为使患者得以保留眼球及部分视力,也开发了各种保守治疗方法,如光疗、放射性敷贴、近距离放疗和免疫治疗,但效果并不理想,需进一步提高疗效。因此,探索葡萄膜黑色素瘤(UVM)基因治疗的新技术、新方法,具有十分重要的意义。目的研究钙整合素结合蛋白-1(Calcium and intergrin binding protein-1,CIB1)在葡萄膜黑色素瘤(UVM)中的表达情况及其对UVM病人生存和预后的重要意义,为今后指导葡萄膜黑色素瘤治疗、评估葡萄膜黑色素瘤患者预后以及防治葡萄膜黑色素瘤相关策略提供新的方法。方法利用基因表达谱数据交互分析GEPIA(Gene Expression Profiling Interactive Analysis)数据库、癌症芯片数据库(UALCAN)这些在线数据库分析CIB1在葡萄膜黑色素瘤组织中的差异表达、CIB1在葡萄膜黑色素瘤组织中表达水平与预后的关系以及与CIB1的相关基因。应用癌症基因组学分析网站(CBioPortal)分析CIB1在葡萄膜黑色素瘤及其它组织中基因突变情况。通过STRING数据库进一步构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)。另外,我们还利用STRING和GeneMANIA数据库的综合分析预测了 UVM中与CIB1相关的基因,验证了 UVM中与CIB1相似的基因表达和生存热图。最后,我们在临床上收集了正常眼体葡萄膜组织、葡萄膜黑色素瘤组织,并对这两组组织进行免疫组化染色病理检查CIB1的表达情况。结果通过免疫组化检测,我们发现,与正常眼体葡萄膜组织样本相比,葡萄膜黑色素瘤的瘤体组织中CIB1的表达明显增强(P<0.05)。CIB1在葡萄膜黑色素瘤中的表达与体重、性别无关。但是,CIB1因子的表达与葡萄膜黑色素瘤的分期、葡萄膜黑色素瘤患者的年龄和葡萄膜黑色素瘤患者的病理分级相关(P<0.05)。并且,CIB1的高表达会使萄膜黑色素瘤患者的生存率显著下降(P<0.05)。同时研究数据显示,CIB1在葡萄膜黑色素瘤组织中的表达与它的分级、分期和种族、性别相关,特别是CIB1的表达水平在肿瘤分级的第四级较3级明显升高。GO功能分析结果提示:CIB1及其相互作用的基因在ITGA2B-ITGB3-CIB1复合物、细胞内蛋白转运的调控、离子转运的调控、细胞对肿瘤坏死因子的反应、凋亡过程的正向调控等方面显著富集。cBioPortal突变分析显示,目前TCGA-UVM样本中未检测到突变,但UVM患者中发现了几个增益、二倍体和浅缺失。甲基化分析结果发现:葡萄膜黑色素瘤患者的分期、年龄、性别可能对UVM患者的CIB1启动子甲基化影响不大。然而,患者体重却可能改变UVM患者启动子甲基化水平。蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)分析提示:CIB1与GUF1、CRY2、PLK3、ACTN4、PSEN2、ITGA2B、ITGB3、MAP3K5、CABP1、SPICE1、ARHGEF1 等 11 个因子相互作用较大。结论综上所述,我们的新发现提示CIB1可能是UVM的潜在诊断预测因子,有望成为葡萄膜黑色素瘤基因诊断、治疗及预后的靶基因。
其他文献
自2012年以来,中国经济开始显现出下行压力,传统行业在发展过程中步履维艰,尤其是制造业企业,开始面临产能过剩,产业经济结构转型等问题。制造业行业内增长面临严峻挑战,制造业企业迫切需要寻求突破和转型,寻找新的经济利润增长点。然而,传统企业在转型方面,有着行动迟缓、执行力不足、思维方式受限等天然劣势。因此,传统企业要转型,除了进行艰难的自我革新,更可以选择通过投资与并购,借助资本的力量实现转型。基于
中介轴承工作于高温、高转速和润滑困难的工作环境中,极易发生故障,中介轴承一旦出现故障会对航空发动机造成致命影响。因此,实现中介轴承故障诊断对航空发动机状态检测与故障诊断具有重要意义。针对中介轴承故障信号传递路径长,故障特征难以获取等问题,本文将信息熵和量子理论相结合,提出一种基于最优特征的随机森林中介轴承故障诊断方法。首先,根据航空发动机中介轴承的工作位置及结构特点,设计双转子中介轴承故障模拟实验
随着“厕所革命”在全国范围内的开展,媒体对其关注度日益提升。这一行动是国家在环境领域的重要部署,“厕所革命”能够反映国家形象的三大维度:区域维度、国民维度和政府维度。“厕所革命”报道全面建构了国家形象。2015年开始,中国在全国范围内开展“厕所革命”,这一行动覆盖和影响范围广、持续时间长,对中国国家形象的研究具有代表性和典型性。《人民日报》《光明日报》代表了国家对内传播的主阵地,《中国日报》代表了
在天然气生产过程中,由于局部的高压低温环境,生成天然气水合物引发设备堵塞,现场主要通过注入热力学抑制剂和动力学抑制剂来解决这类问题。本文通过动力学模拟的方法,模拟动力学抑制剂抑制天然气水合物生长的过程,探究其抑制机理,将动力学抑制剂与热力学抑制剂复配,得到最佳的浓度组合。采用蒙托卡罗方法计算了甲烷分子在空笼形水合物中的吸附,获得的最适宜吸附位置与甲烷水合物中甲烷的位置完全一致,验证甲烷水合物结构模
我国经济增长数据质量一直是国内外各界密切关注的问题,部分学者对于我国经济增长数据的怀疑损害了我国的国际形象,所以说,找到一种科学合理的数据质量评估方法具有重要的现实意义。因此,本文选用稳健主成分回归方法对我国经济数据质量进行评估,该方法不仅可使求出的回归估计不受异常值的强烈影响,而且能更好地识别异常点。本文在稳健主成分分析阶段使用了KSD+Rocke估计法得到稳健的均值向量和协方差矩阵,在稳健回归
本文为在设计院实际工作中,在充分了解国内和国外BIM技术应用现状的基础上,通过分析四种常用三维仿真软件的建模性能,研究各个软件在协同设计方面的优缺点和适用性,最终比选出适合BIM模型构建和协同设计控制的软件来进行应用。并且通过对实际项目的BIM信息模型的创建,并且对建立的BIM信息模型在施工图纸中如何碰撞检查及校对,来实现BIM技术在多专业间协同设计及应用。第1章为绪论,首先详细阐述了论文的选题背
表赔偿的用词经历了从先秦的“更”“庚”“赏”,到秦汉以降唐代之前的“负”“负偿”“负赏”“责”“备”等,到了唐时又添了“酬”“陪”“陪备”等词。而这些表赔偿之意用
近年来,在线社交活动与日俱增,越来越多的人倾向于在网络上发表意见和表达情感,与之而来的在线评论数据也日益繁多。通过对这些数据的提取、分类和分析,可以帮助我们了解不同人对不同事物所表达的观点和情感。在线评论数据的分析对网络情报舆情、网络安全等方面具有重要的意义,因此对相关数据分析技术的研究和探讨变得尤为重要。虽然已有很多不同领域和学科的检测方法相继被提出,但目前的检测模型针对不同数据仍存在许多不足之
一、国企加强意识形态工作的重要意义国企加强意识形态工作是贯彻落实"意识形态工作是党的一项极端重要的工作"的具体体现,是建设具有强大凝聚力和引领力的社会主义意识形态
我国海域蕴藏着丰富的油气资源,目前陆地油气产量呈现递减趋势,而国家的石油需求量稳步增长,海上油田产量的持续增长已经成为国家石油产量增长和产量接替的重要组成部分。因此,本文针对海上S油田进行研究,采用油藏工程和数值模拟等技术对S油田二次局部加密潜力进行圈定,并最终得到局部层系细分和井网加密方案。首先通过选取采收率、水驱储量控制程度、水驱储量动用程度、含水上升率、递减率、阶段存水率、阶段水驱指数、地层