黄瓜单性吉实相关基因的分离、表达及SSR标记分析

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黄瓜(Cucumis sativus L.)是葫芦科(Cucurbitaceae)甜瓜属(Cucumis)蔬菜作物,起源于喜马拉雅山南麓的印度北部地区。目前在世界各地广为栽培,是世界十大蔬菜作物之一。单性结实性是黄瓜保护地专用新品种的目标性状之一,强单性结实品种对于在低温、弱光和无虫媒的设施栽培条件下,克服黄瓜“化瓜”、畸形瓜率较高的现象具有重要的作用;因此,加强对单性结实性的深入研究对保护地黄瓜遗传改良具有重要意义。生长素是引起黄瓜天然单性结实性的主要激素,其它植物生长调节剂起间接作用。生长素的转录调控受Aux/IAA蛋白和转录因子ARF(Auxin response factor)家族的影响,Aux/IAA能和ARFs形成杂合二聚体,在生长素的作用下,Aux/IAA被降解,从而调动生长素信号途径,启动果实发育。   本研究利用最新公布的黄瓜基因组测序信息,利用模式植物拟南芥和水稻数据库信息,根据序列同源性、序列比对、结构域分析等生物信息学和系统发育学的方法分离、鉴定、分析了黄瓜中生长素信号传导途径中两大转录因子Aux/IAA和ARF家族。然后对Aux/IAA家族和ARF基因家族中某些成员在发育的黄瓜果实中进行了的表达分析,Aux/IAA家族基因Csa016715和ARF基因家族基因Csa019264、Csa010564Csa012805在发育中的果实中都有较高水平表达。推测这几个基因可能对黄瓜果实的发育起促进作用。此外本研究还从基因组角度出发,在单性结实和非单性结实材料中筛选了386对伴随黄瓜基因组计划完成而开发的SSR标记,发现引物SSR22338在大多数F2单性结实群体中有特异条带,而在大多数非单性结实中不存在特异条带,因此该引物很可能与单性结实主效QTL连锁。
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