Pannonibacter phragmitetus是一种兼性需氧、非发酵糖类的革兰氏阴性杆菌。目前有关P.phragmitetus的研究集中于重金属解毒。P.phragmitetus是机会性感染病原体,尽管仅有4例报道,其未发现的感染数目可能很大。该菌是多耐药菌,其耐药机制、致病机制、重金属代谢机制未曾报道。针对这些疑问,本论文对一株来源于肝脓肿病人的细菌P.phragmitetus31801,进行了抗生素耐药性测试(AST)和基因组测序。AST显示对氨基糖苷类、氟喹诺酮类、四环素类、硝基呋喃类抗生素耐药,可以指导对该菌感染治疗。P.phragmitetus 31801全基因组测序使用PacBio RS II平台,获得P.phragmitetus 31801基因组由一个完整的染色体和一个闭环质粒(p.p-1)组成。运用基因组平均核苷酸一致性(ANI)的分析方法将P.phragmitetus 31801细菌明确归类到P.phragmitetus种。在前噬菌体、基因岛、比较基因组方面,使用CRISPRFinder、PHAST、IslandViewer、Mauve等软件,发现P.phragmitetus31801基因组上共有5个CRISPR、3个前噬菌体和21个基因岛,并推测P.phragmitetus 31801的前噬菌体A可能由环境菌株水平转移来。利用ARDB、CARD、RAST、VFDB和等多功能数据库在该基因组发现了大量与耐药机制、致病机制、重金属代谢机制等相关的基因。在耐药基因方面,发现了β-内酰胺类、喹诺酮类、磷霉素等抗生素相关的耐药基因,从基因组水平上部分解释了该菌对β-内酰胺类、喹诺酮类和磺胺类抗生素药物耐药的机制。在致病机制方面,发现P.phragmitetus 31801致病性是由于其含有编码毒力因子、鞭毛、分泌系统等基因。在重金属代谢方面,发现其具有代谢铬、汞、镉等重金属元素的基因,可以解释该菌在重金属代谢的潜力。以上的研究初步提示了P.phragmitetus 31801抗生素耐药性、致病力和重金属代谢的原因,为进一步实验室研究打好基础。