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随着分子生物学的发展，遗传标记的概念发展为在核酸分子水平上具有相对差异的等位区域。STR基因座遵循孟德尔遗传规律，在基因组中分布广泛，具有PCR扩增，电泳分型等优点，在生物学各领域中得到广泛应用。在亲权鉴定、个体识别应用中，由于STR系统的使用，使检测进入了一个新的阶段，检测水平有了空前的提高。本研究的目的在于：①分析奶牛和肉牛6个STR基因座遗传多态性；⑦用微卫星标记技术建立准确快捷的亲权鉴定方法。 1 奶牛和肉牛6个STR基因座遗传多态性研究 试验所用样本采自两个品种，共161个样本。其中9份中国荷斯坦奶牛种公牛精液样本，23个家系中49份中国荷斯坦奶牛（母）血液样本；103份西门塔尔等肉牛品种种公牛精液样本。分别提取DNA，应用6对微卫星引物对奶牛和肉牛进行遗传多态性研究。利用PCR技术和复合电泳银染技术检测奶牛和肉牛BM2113、BM1862、BMc701、BM2934、TGLA122、BM720等6个STR基因座的多态性分布，并计算该6个基因座的基因频率（Pi）、个体鉴别力（DP）、杂合度（H）、多态信息含量（PIC）、和非父排除概率（PE）。结果显示：6个STR基因座的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡，奶牛中6个STR基因座中BM2113基因座的DP、H和PIC最高，TGLA122基因座的PE最高。6个STR基因座的累积个体鉴别力(CDP为0.99997，累积非父排除能力(CPE)为0.98827。肉牛中6个STR基因座中BM1862基因座的DP、H、PIC、PE都是最高，6个STR基因座的累积个体鉴别力(CDP)为0.99999，累积非父排除能力(CPE)为0.99578。6个STR基因座具有高度遗传多态性，可用于牛的遗传连锁分析、个体识别和亲权鉴定等研究领域。 2 应用微卫星分子标记对奶牛和肉牛进行亲权鉴定 运用PCR技术对BM2113、BM1862、BMc701、BM2934、TGLA122、BM720共6个STR基因座进行扩增，扩增产物分两组混合后经聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测，扩增片段互不干扰。通过分析确定母女关系的2头奶牛血液样本和5个嫌疑父亲的精液样本的DNA，一头母本已知的奶牛在嫌疑父本中找出父亲，并计算父权概率，这6个STR基因座用于亲权鉴定获得99.993％的父权概率。证明用银染法检测STR基因座扩增产物可用于奶牛亲权鉴定。