对白粉菌无毒基因进行遗传分析可为无毒基因的分子标记打下基础，进一步研究可分离克隆无毒基因，构建小麦的双元传感系统，利用无毒基因和其对应的抗病基因获得广谱持久的抗病品种，以解决小麦品种抗性易于丧失的问题。在温室中鉴定小麦白粉菌E16和E25杂交得到的89个后代菌株，对其无毒基因进行遗传分析。结果表明：对应Pm3d的无毒性由3对隐性基因控制；对应于Pm19和Pm3b的无毒性分别由2对隐性基因控制；对应抗病基因Pm4a和Pm4b的无毒性分别由1对基因控制，此外还证实了无毒基因Avr4a和Avr4b紧密连锁，其重组率为1.1％。 在遗传分析基础上，使用BSA(bulked segregant analysis)方法寻找和无毒基因连锁的RAPD标记。在180条随机引物的扩增产物中未得到与目的基因连锁的标记。用随机引物OPD03进行RAPD分析时，对Pm4a无毒性亲本DNA的产物中有一条分子量约为2.0～2.5kb的带，而毒性亲本DNA的扩增产物中没有此带。进一步分析发现该条带在杂交后代群体中呈现1：1的分离比，但其存在与毒性分离相独立，推测该条带与小麦白粉菌决定交配型或其他未知性状的基因相连锁，但尚需进一步实验的证实。 为了解我国小麦主产区小麦白粉菌群体遗传多样性，对湖北、江苏、北京、河南、山东、山西已知毒性的84个小麦白粉病菌株进行RAPD分析。对他们按省(市)分群体，江苏省白粉菌群体一致度平均值最大(0.8186)而遗传距离平均值最小，说明其群体多样性水平较低；河南省的群体具有最小的一致度平均值(0.6457)，和其它群体相比其多样性水平最高。6个白粉菌群体间的一致度较高而遗传距离较小，RAPD分析得到群体间的遗传距离平均值为0.0321，一致度的平均值为0.9685，这表明我国小麦白粉菌可能有相同的起源中心，不同地区间可能存在病菌的迁移。菌株个体间遗传距离平均值为0.3382，一致度平均值为0.7249，说明小麦白粉菌有较高的遗传多样性。对RAPD结果进行聚类分析，将湖北和河南的群体分为一组，北京、山东和山西的群体分为一组，他们的距离较近(0.0230)，而江苏和它们的遗传距离较远(0.0353)。用类平均法分别根据RAPD扩增产物和菌株的毒性对白粉菌群体进行聚类，比较聚类结果发现这两者没有密切关系。