组织结构是多校区大学管理的核心问题,研究多校区大学的组织结构是多校区大学管理的现实需要。中国多校区大学作为一种新的高等教育组织形式,主要是在政府的行政力量推动下形成的。它的出现对实现我国高等教育的跨越式发展起到积极作用,既满足了广大人民群众对高等教育强烈的需求,又促进了社会、经济、科技的发展；但它的出现同时也给高校的管理带来了一系列重大理论与实践问题,如何解决这些问题直接关系到多校区大学的健康发展。本文以南昌理工学院多校区的现实情况为研究背景,分析了多校区组织管理存在的管理层次过多、决策程序不科学、工作职责不明确、组织结构缺乏有效性等问题。根据学院多校区的特点,提出了学院多校区组织设计的思路,研究分析了多校区大学组织结构设计的、基本组织结构和沟通协调机制设计等问题。通过加强扁平化管理,转变工作职能,学术、行政权力适度分离,以及利用网络化管理的形式,进一步优化南昌理工学院多校区的组织结构。最后,重点阐述了扁平化管理和计算机网络技术结合下的南昌理工学院管理信息系统的设计思路,并以教务管理子系统为例,给出了其具体设计过程。