NALP3基因多态性与痛风性关节炎遗传易感性的研究

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目的:NALP3基因多态性与多种自身免疫炎症疾病相关,但其与痛风关节炎的关系尚未明确。本研究采用MassARRAY系统对NALP3基因的9个tagSNPs位点及2个错义SNP位点在中国男性原发性痛风患者及正常对照人群中进行了分型,旨在明确该基因多态性与原发性痛风关节炎的关系。方法:利用基因测序及限制性内切酶技术初步筛查第3外显子,应用Hapmap数据库寻找tagSNP;收集散发痛风患者及正常对照各480例,取其外周抗凝血,QIAGEN试剂盒提取基因组DNA,采用聚合酶链(PCR)方法扩增所有DNA标本的11个目标位点所在区,最后采用MALDI-TOF质谱技术平台对上述SNP进行分型检测。数据分析,Haploviewer软件检验SNP位点的Hardy-Weinberg平衡;采用x2检验比较两组基因型及等位基因频率差异;应用Haploview软件进行单倍型分析。结果:1.NALP3基因序列分析结果第3外显子区初步筛查发现2个SNP位点,后根据hapmap数据库及haploview软件运行结果,最终选取包含上述2个位点在内的9个tagSNP及2个非同义SNP位点进行分型检测。2.SNP位点Hardy-Weinberg平衡检验9个SNP位点在960例研究对象中的分布有8个符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),SNP rs10754555的Hardy-Weinberg检验不平衡,在后面的统计分析中剔除。3.基因型及等位基因频率比较对8个tagSNP位点的等位基因频率及基因型频率进行比较,结果显示,痛风关节炎患者和正常对照组人群等位基因频率分布差异无显著性(P>0.05),两组各基因型频率分布亦不具有显著差异(P>0.05),同时在该群体中未检出错义SNP位点。4.单倍型分析对8个SNP位点所组成的单倍型进行分析,对于单组中频率<2%的单倍型,其群体代表性差,不予统计。结果显示,两组间主要的单倍型分布频率无差异。结论:中国汉族男性痛风人群NALP3基因上述位点的多态性与原发性痛风关节炎发病无明显关联,尚需进一步研究证实其他区域位点多态性与痛风关节炎的关系。
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