我国首批农村商业银行于2001年在江苏省成立,经过十多年的改革发展,农村商业银行在机构数量、资产规模、分布范围和资产质量等方面都完成了质的飞跃,迅速成为农村金融体系的重要组成部分,在服务“三农”、支持农村经济发展和推进城乡一体化等方面发挥着重要作用。近年来,随着我国农村地区经济的发展以及国家对农村金融限制的放松,越来越多的金融机构开始进入农村地区,使得农村商业银行面临着巨大的冲击和挑战。在资源有限和竞争激烈的的环境下,农村商业银行亟需提高自身效率才能在新的环境中站稳脚跟,实现健康可持续发展。因此,对我国农村商业银行当前效率处于何种水平、哪些因素对农村商业银行的效率存在影响以及如何提高农村商业银行效率的研究具有重大意义。本文在已有的银行效率研究基础上,重点对农村商业银行的微观效率及其影响因素进行了研究。首先,本文对银行效率的内涵、银行效率分类以及银行效率测度方法等理论进行了阐述。其次,运用数据包络分析法(DEA)对12家农村商业银行、4家国有商业银行和4家股份制商业银行的效率进行了测度,并就各类商业银行的效率值进行了对比分析,结果表明农村商业银行的整体运营效率要低于后两者。接着,在效率测度的基础上运用固定效应面板模型对影响农村商业银行效率的因素进行了回归分析,实证结果表明:资产规模、存贷比和非利息收入比与农村商业银行的效率呈显著正相关关系,即通过扩大资产规模、提高存贷比率和提升非利息收入比能提高我国农村商业银行的效率;而资本充足率、前十大股东占股比例和不良贷款率与农村商业银行的效率呈显著负相关关系,即资本充足率、前十大股东占股比例和不良贷款率的提升会导致农村商业效率的下降。最后,通过对前文理论分析与实证分析的总结,针对如何提高我国农村商业银行效率,提出可行性的对策建议。