多发脑胶质母细胞瘤的全基因组、表观基因组分析及分子概况

来源 :天津医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:hheeuuuu
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百分之十到二十的新发胶质母细胞瘤发病时存在多发病灶,称为多灶性胶质母细胞瘤或多中心性胶质母细胞瘤(M-GBM)。这些病人的预后要比单发胶质母细胞瘤差。但是目前还不清楚多发胶质瘤是否有着独特的基因组、表观基因组或分子基础。我们从TCGA数据库中203例有术前核磁共振图像的新发胶质母细胞瘤病人中,鉴定出30例多发胶质瘤,然后综合分析了这30例病人的全基因组基因突变、全基因组拷贝数变化、全基因组启动子甲基化及基因表达情况,并与173例单发胶质母细胞瘤的相应数据进行对比。我们发现多发胶质母细胞瘤缺乏IDH1、ATRX或PDGFRA突变,多发胶质母细胞瘤病人中间质型常见。同时,我们还发现CYB5R2在多发胶质母细胞瘤病人中表达水平升高、而且CYB5R2的启动子甲基化水平在多发胶质母细胞瘤中降低。CYB5R2的表达水平在两个大型胶质瘤病人数据库,共超过700例胶质瘤病人中与预后负相关,CYB5R2表达水平高的病人预后差。IDH1突变与CYB5R2启动子甲基化明显相关,但CYB5R2表达水平对预后的影响却独立于IDH1突变。CYB5R2的表达与抗原成熟及分解过程以及免疫调节密切相关。这些结果表明,多发胶质母细胞瘤有着一些独特的基因组、表观基因组特征,并且多发胶质母细胞瘤病人预后较差,CYB5R2是一个新的表观基因组标志物。
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