将干燥的黄芩地上部分用无水乙醇浸泡提取，醇提液浓缩后用水分散，依次用石油醚、乙酸乙酯和正丁醇萃取，制得正己烷提取物占黄芩地上部分质量的1.9%，乙酸乙酯提取物占黄芩地上部分质量的0.3%，正丁醇提取物占黄芩地上部分质量的1.2%。利用柱层析、HPLC以及重结晶等分离方法分别对石油醚、乙酸乙酯和正丁醇提取物进行分离、纯化，得到21个单一化合物；通过理化性质和波谱数据分析，并结合文献鉴定它们的结构分别为：脱镁叶绿酸a甲酯(1)，β-谷甾醇-3-O-β-D-葡萄糖苷(2)，对羟基苯乙醇十六酸酯(3)，α-菠甾醇(4)，β-谷甾醇(5)，甘油-1-亚油酸-3-亚麻酸酯(6)，5,6,7,4′-四羟基二氢黄酮(7)，脱镁叶绿酸a乙酯(8)，正十八烷醇(9)，5,7-二羟基-6-甲氧基二氢黄酮(10)，5,7-二羟基-6-甲氧基黄酮(11)，5,7-二羟基黄酮(12)，5,7,4′-三羟基黄酮(13)，叶黄素(14)，5,4′-二羟基-6,7,8,3′-四甲氧基黄酮(15)，5,2′-二羟基-6,7,8,3′-四甲氧基黄酮(16)，5,2′-二羟基-7,8,6′-三甲氧基黄酮(17)，5,2′-二羟基-7,8-二甲氧基黄酮(18)，5,2′-二羟基-6,7,8-三甲氧基黄酮(19)，芹菜素-4’-O-β-D-吡喃葡萄糖苷(20)，芹菜素-7-O-β-D-吡喃葡萄糖苷(21)。其中，化合物3为未见报道的新化合物，7、10、11、15~21系首次从黄芩地上部分中分离得到。对黄芩地上部分的石油醚、乙酸乙酯和正丁醇提取物的抗植物病菌活性测试结果表明：乙酸乙酯提取物对番茄霜霉病菌、黄瓜角斑病菌和水稻纹枯病菌均有抑制作用，并且随着浓度的增加而增强。