【摘 要】
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该文以高等真核生物的基因发现技术为研究对象,首先,讨论了基于隐式马尔可夫模型(HMM)的基因发现系统及其不足.随后设计了我们的基因发现系统.我们在HMM的扩展形式-泛化的隐
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该文以高等真核生物的基因发现技术为研究对象,首先,讨论了基于隐式马尔可夫模型(HMM)的基因发现系统及其不足.随后设计了我们的基因发现系统.我们在HMM的扩展形式-泛化的隐式马尔可夫模型(GHMM)的基础上,建立了一个基因发现系统的框架,用以将系统的各个子模块整合起来,以搜索潜在的基因.在该系统中,我们将基因结构的信息引入搜索算法,提出了在导出序列上使用Viterbi算法来寻找可能的基因结构的方法,并给出了具体的算法.之后,我们从系统的子模块中选择了拼接信号模块作为研究重点.实现并测试了两种被广泛使用的模型:权值矩阵模型,权值数组模型,并对测试结果进行了比较和详细的分析,为系统进一步的开发打下了坚实的基础.同时,我们也讨论了内容探测器模型和其他子模块模型的设计和实现问题.
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