青海高原结核分枝杆菌耐药特征研究

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目的:了解青海地区结核分枝杆菌对一线抗结核药物的耐药现状;探讨结核分枝杆菌耐药相关基因突变在敏感或耐药菌株中是否有差异。方法:对青海地区分离的198株结核分枝杆菌用改良罗氏培养基进行培养,采用比例法进行耐药性检测,分析该地区耐药状况与人口学特征的关系,并对结果进行统计学分析。采用传统水煮法提取结核分枝杆菌DNA,对异烟肼作用于结核分枝杆菌的基因kat G,pre-inh A及oxy R-ahp C间隔区进行扩增,利福平作用于结核分枝杆菌的基因rpo B进行扩增,乙胺丁醇作用于结核分枝杆菌的基因emb B进行扩增,链霉素作用于结核分枝杆菌的基因rps L和gid B进行扩增。对结核分枝杆菌耐药和敏感的菌株进行基因突变描述,并对结果进行统计学分析。基因测序药物作用相关基因的突变诊断结核菌的耐药性与传统比例法对结核菌耐药性检测的敏感性,特异度,阴性似然比,阳性似然比及kappa值。结果:1.198株结核分枝杆菌总耐药率为58.59%(116/198),四种一线药物耐药率由高到底依次为异烟肼(45.96%,91/198)>利福平(43.94%,87/198)>链霉素(40.91%,81/198)>乙胺丁醇(30.30%,60/198)。青海地区结核分枝杆菌耐药状况与地区和年龄有关(χ~2=5.236,P=0.022;χ~2=8.796,P=0.032),与性别和民族无关(χ~2=0.871,P=0.351;χ~2=0.011,P=0.916)。2.基因测序196株菌,对异烟肼耐药的89株结核分枝杆菌中kat G315位点突为61.80%(55/89),107株异烟肼敏感菌株中kat G315位点突变率为3.74%(4/107),kat G315位点突变在敏感或耐药的结核分枝杆菌中存在差异(χ~2=40.251,P<0.001)。19株株结核分枝杆菌在oxy R-ahp C间隔区发生了突变,突变率为9.69%(19/196);耐药株有17株,突变率为19.10%(17/89);敏感株有2株发生突变,突变率1.87%,oxy R-ahp C间隔区突变在结核分枝杆菌敏感或耐药菌株中存在差异(χ~2=13.456,P<0.001)。7株结核分枝杆菌在pre-inh A发生突变,突变率为3.57%,3株耐药菌发生了突变,突变率为3.37(3/89),4株敏感菌有突变,突变率为3.74%(4/107),pre-inh A突变在结核分枝杆菌敏感或耐药菌株中突变无差异(χ~2=0.019,P=0.890)。3.196株测序的结核分枝杆菌中耐药菌株占43.37%(85/196)株,敏感菌株占56.63%(111/196),共有72株菌发生了突变,突变率为36.74%(72/196)。85株耐药菌中基因突变率81.18%(69/85),111株敏感菌中基因突变率2.70%(3/111),结核分枝杆菌对利福平耐药或敏感与rpo B基因突变有关(χ~2=124.199,P<0.001)。4.196株结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药率为30.10%(59/196),敏感菌株为69.90%(137/196),emb B基因突变率为20.41%(40/196)。59株EMB耐药结核分枝杆菌emb B基因突变率为45.76%(27/59),137株EMB敏感结核分枝杆菌emb B基因突变率为9.49%(13/137),emb B基因突变与结核分枝杆菌对EMB耐药或敏感有关(χ~2=33.406,P<0.001)。5.196株测序的结核分枝杆菌中,链霉素耐药菌占40.82%(80/196),80株耐药结核分枝杆菌rps L基因突变率56.25%(45/80),链霉素敏感菌株占59.18%(116/196),116株结核分枝杆菌rps L基因突变率19.83%(23/116),结核分枝杆菌链霉素耐药或敏感与rps L基因突变有关(χ~2=27.722,P<0.001)。共测序192株结核分枝杆菌的gid B基因,10株结核菌未发生基因突变,占5.21%(10/192)。182株结核菌发生了突变,突变率为94.79%(182/192);173株结核菌同时发生gid BE92D和gid BA205A突变,78株耐药菌中69株为gid BE92D和gid BA205A同时突变,突变占耐药株的88.46%(69/78),114株敏感菌中104株gid BE92D和gid BA205A同时突变,占敏感株中的91.23%(104/114),结核分枝杆菌gid BE92D位点和gid BA205A位点突变与结核分枝杆菌耐链霉素没有关系(χ~2=0.398,P=0.528)。结论:青海地区结核分枝杆菌耐药情况严重,高于全国水平。结核分枝杆菌对异烟肼,利福平,乙胺丁醇和链霉素产生耐药与耐药相关基因突变有关,检测耐药突变相关位点可以快速诊断结核分枝杆菌的耐药情况。
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