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一个新的功能性单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)位点rs2274223,在三个基于中国人群有关食管鳞癌(Esophagealsquamouscellcarcinoma,ESCC)的大规模全基因组关联分析(Genome-wideassociationstudy,GWAS)研究中均被发现,其位于磷脂酶Cε1(phospholipaseCepsilon1,PLCE1)基因。PLCE1基因编码的PLCE1(phospholipaseCepsilon1)蛋白是磷脂酶C(phospholipaseC,PLC)家族一个独特的成员,其可以催化多磷酸肌醇水解,产生1,4,5-三磷酸(Inositol,1,4,5-triphosphate,IP3)和二酰甘油(diacylglcerol,DAG)两种第二信使,继而参与细胞的生长和分化。因此,深入探讨PLCE1基因多态性与食管鳞癌的关系尤为必要。这将为探讨食管鳞癌的病因学提供科学依据,同时,这将对筛选高危人群和保护易感人群有重要意义,也为采取有效的干预措施提供理论基础。
目的:
探讨PLCE1基因三个功能性位点的多态性与食管鳞癌的关系以及基因-基因,基因-环境的交互作用,为揭示食管癌病因学机制提供理论依据。
方法:
在中国中部汉族人群中,采取病例-对照研究方法,按照频数匹配原则,选取381例医院来源的食管鳞癌新发病例和420例健康对照,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对rs17417407位点和rs2274223位点进行基因型检测;采用等位基因特异聚合酶链反应(Allele-specificPCR,AS-PCR)技术对rs2274224位点进行基因型检测。
利用统计学软件SPSS17.0,对病例组和对照组的样本特征进行频率描述,利用x2检验比较食管鳞癌患者和健康对照组之间的年龄、性别、吸烟、饮酒及肿瘤家族史的差异,采用Hardy-weinberg在线分析软件分析Hardy-Weinberg平衡。采用非条件二分类Logistic回归比较各基因型在病例组和健康对照组之间分布频率的差异。利用Haploview4.0软件计算连锁不平衡值(LD)值。利用SHEsis在线软件进行单体型预测、构建及分析。利用趋势x2检验,分析突变位点数量与食管鳞癌发病风险之间的剂量反应关系。利用多因素降维法(MDR)分析基因-环境交互作用。
结果:
单个SNP位点分析表明,rs2274223位点突变杂合基因型AG、突变纯合基因型GG及联合突变基因型(AG+GG)均能增加食管鳞癌的发病风险,其OR(95%CI)分别为1.80(1.30,2.49)、2.80(1.45,5.39)、1.92(1.41,2.62)。rs2274224位点突变杂合基因型CG能降低食管鳞癌的发病风险(OR:0.65,95%CI:0.46-0.91)。单体型Grs17417407Ars2274223Crs2274224可降低食管鳞癌的发病风险(OR:0.76,95%CI:0.62-0.93),同时,单体型Grs17417407Grs2274223Crs2274224、Trs17417407Grs2274223Crs2274224均可增加食管鳞癌的发病风险,其OR(95%CI)分别为1.75(1.33,2.18)、2.51(1.15,5.49)。基因-环境交互作用分析显示,最优模型为rs2274223、rs2274224、肿瘤家族史及吸烟四因素的交互。该模型交叉验证的统计量及其对应值分别为训练集平均精度:0.66、测试集平均精度:0.58、十重交叉验证的一致率(比值)为7∶10。结果表明,在该模型中“高危”人群食管鳞癌的发病风险是“低危”人群的3.67倍(OR:3.67,95%CI:2.74-4.92)。
结论:
PLCE1基因rs2274223位点的多态性与中国中部汉族人群食管鳞癌发病有关,等位基因G能增加食管鳞癌的发病风险。rs2274224位点的多态性与中国中部汉族人群的食管鳞癌发病有关,CG基因型能降低食管鳞癌的发病风险。单体型GGC和TGC是中国中部汉族人群食管鳞癌的危险因素;单体型GAC是中国中部汉族人群食管鳞癌的保护因素。PLCE1基因3位点具有联合效应,随着个体携带等位基因突变个数的增加,食管鳞癌的发病风险呈现随之增加的趋势。rs2274223位点、rs2274224位点、肿瘤家族史和吸烟在食管鳞癌的发生中具有交互作用。