PLCE1基因多态性与中国中部人群食管鳞癌遗传易感性

来源 :郑州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:appleqj
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
一个新的功能性单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)位点rs2274223,在三个基于中国人群有关食管鳞癌(Esophagealsquamouscellcarcinoma,ESCC)的大规模全基因组关联分析(Genome-wideassociationstudy,GWAS)研究中均被发现,其位于磷脂酶Cε1(phospholipaseCepsilon1,PLCE1)基因。PLCE1基因编码的PLCE1(phospholipaseCepsilon1)蛋白是磷脂酶C(phospholipaseC,PLC)家族一个独特的成员,其可以催化多磷酸肌醇水解,产生1,4,5-三磷酸(Inositol,1,4,5-triphosphate,IP3)和二酰甘油(diacylglcerol,DAG)两种第二信使,继而参与细胞的生长和分化。因此,深入探讨PLCE1基因多态性与食管鳞癌的关系尤为必要。这将为探讨食管鳞癌的病因学提供科学依据,同时,这将对筛选高危人群和保护易感人群有重要意义,也为采取有效的干预措施提供理论基础。   目的:   探讨PLCE1基因三个功能性位点的多态性与食管鳞癌的关系以及基因-基因,基因-环境的交互作用,为揭示食管癌病因学机制提供理论依据。   方法:   在中国中部汉族人群中,采取病例-对照研究方法,按照频数匹配原则,选取381例医院来源的食管鳞癌新发病例和420例健康对照,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对rs17417407位点和rs2274223位点进行基因型检测;采用等位基因特异聚合酶链反应(Allele-specificPCR,AS-PCR)技术对rs2274224位点进行基因型检测。   利用统计学软件SPSS17.0,对病例组和对照组的样本特征进行频率描述,利用x2检验比较食管鳞癌患者和健康对照组之间的年龄、性别、吸烟、饮酒及肿瘤家族史的差异,采用Hardy-weinberg在线分析软件分析Hardy-Weinberg平衡。采用非条件二分类Logistic回归比较各基因型在病例组和健康对照组之间分布频率的差异。利用Haploview4.0软件计算连锁不平衡值(LD)值。利用SHEsis在线软件进行单体型预测、构建及分析。利用趋势x2检验,分析突变位点数量与食管鳞癌发病风险之间的剂量反应关系。利用多因素降维法(MDR)分析基因-环境交互作用。   结果:   单个SNP位点分析表明,rs2274223位点突变杂合基因型AG、突变纯合基因型GG及联合突变基因型(AG+GG)均能增加食管鳞癌的发病风险,其OR(95%CI)分别为1.80(1.30,2.49)、2.80(1.45,5.39)、1.92(1.41,2.62)。rs2274224位点突变杂合基因型CG能降低食管鳞癌的发病风险(OR:0.65,95%CI:0.46-0.91)。单体型Grs17417407Ars2274223Crs2274224可降低食管鳞癌的发病风险(OR:0.76,95%CI:0.62-0.93),同时,单体型Grs17417407Grs2274223Crs2274224、Trs17417407Grs2274223Crs2274224均可增加食管鳞癌的发病风险,其OR(95%CI)分别为1.75(1.33,2.18)、2.51(1.15,5.49)。基因-环境交互作用分析显示,最优模型为rs2274223、rs2274224、肿瘤家族史及吸烟四因素的交互。该模型交叉验证的统计量及其对应值分别为训练集平均精度:0.66、测试集平均精度:0.58、十重交叉验证的一致率(比值)为7∶10。结果表明,在该模型中“高危”人群食管鳞癌的发病风险是“低危”人群的3.67倍(OR:3.67,95%CI:2.74-4.92)。   结论:   PLCE1基因rs2274223位点的多态性与中国中部汉族人群食管鳞癌发病有关,等位基因G能增加食管鳞癌的发病风险。rs2274224位点的多态性与中国中部汉族人群的食管鳞癌发病有关,CG基因型能降低食管鳞癌的发病风险。单体型GGC和TGC是中国中部汉族人群食管鳞癌的危险因素;单体型GAC是中国中部汉族人群食管鳞癌的保护因素。PLCE1基因3位点具有联合效应,随着个体携带等位基因突变个数的增加,食管鳞癌的发病风险呈现随之增加的趋势。rs2274223位点、rs2274224位点、肿瘤家族史和吸烟在食管鳞癌的发生中具有交互作用。
其他文献
物理是一门思考性极强的学科。在高中的物理教学中,培养学生独立思考的能力尤为重要。著名教育家奥古斯丁认为:教师的主要职责不在于向学生提供现成的知识体系,它的任务是启发学生自我思考,教师的主导作用必须落实到学生的积极性、主动性和创造性上。如何放开手,让学生更好地去独立思考,这是我们物理教师必须要不断探索的一个课题。  一、目前物理教学的一些弊端  物理新课程标准已经实施已经好几年了,科学探究既作为学生
期刊
重庆是硬城.《山海经》里的描述,后有重庆大轰炸时期的形形种种.rn现实环境中的叵测,或可成就审美经验中的多元操作.rn山坚石砌,城险难破.渝人性奇,蜀地多怪.这奇与怪,是故事
期刊
期刊
农村的自然资源蕴藏着丰富多彩的知識宝藏,是教育幼儿的天然素材,自然资源的一点一滴都是幼儿观察和探索的宝物,让幼儿的记忆牢固、思维活跃、提高兴趣。在实践中,我充分利用农村幼儿园的特点和有利的农村自然资源来培养幼儿的科学兴趣和挖掘幼儿的潜能。  一、提供足够的空间让幼儿观察  美丽的大自然是我们的知识宝库,农村的自然环境是对幼儿进行科学教育活动的天然课堂,观察是幼儿认识周围事物的最佳途径。在绿色的春天
期刊
一、命题指导思想  物理(必修科目)的学业水平测试的命题,以教育部制订的《普通高中物理课程标准(实验)》和《江苏省普通高中物理课程标准教学要求》(修订版)为依据,,结合我省高中物理教学实际,注重考查高中物理的基础知识、基本技能和基本的思想方法,适度考查学生的探究与实验能力以及分析问题、解决问题的能力,体现理论与实际联系,反映科技发展的重要成果和科学思想,关注物理学的技术应用以及学生的社会参与意识与
期刊
摘 要:化学课堂教学是科学教育的一个重要的分支,它的特点就是研究物质的组成、结构、性质、以及变化规律的科学,但它最终的教学效果要体现素质教育的基本原则,充分利用适当的教育时机,施以适当的教育,从而激发学生学习化学的策略、激情,最终提高学生学习的效果,培养全面发展的人才。  关键词:高中化学 教学模式 优化 有效性  优化课堂教学的根本目的是引导学生积极主动地参与到学习过程中,并在学习过程中学会学习
搞文学,尤其是写散文,最忌惮的便是被人讥讽为没文化.故许多原本散文写得不错的人,写着写着就开始变得“崇高”和“雅致”(这似乎便是有文化的表现)了起来——这崇高和雅致的
期刊
【摘 要】: 二十一世纪,是信息的社会,在信息社会中,让学生了解并掌握一些基本的信息技术是十分必要的,但信息技术课又不是高考科目,如何能让学生重视起来,如何能让学生行动起来,对我们信息技术老师来说是个不小的挑战。本文以"任务驱动"为主要教学手段,让学生在完成老师布置的简单有趣的任务中掌握信息技术,来提高学生们的学习积极性和创造性。  【关键词】: 信息 信息技术 设计 任务驱动  在信息化社会的今
日前,贵州省委常委、遵义市委书记廖少华涉嫌严重违法违纪被调查。这是党的十八大以来落马的第11个省部级官员。耐人寻味的是,从李春城到廖少华,他们中的不少人都是“台上高
在初中物理教学中,如何让学生带著问题走进新课程呢?经过一段时间的学习和实践,我认为应在以下几个方面深入细致地探讨和研究。  一、重视师生情感的感染与激励  教育工作的最大特点在于它的工作对象都是有思想、有感情的活动着的个体,教师在教学活动中是教学活动的组织者、指导者和参与者。创设提出问题情境,设置问题,首先要注意从学生的角度出发,符合学生的年龄特征和认知规律,要让学生感兴趣,要引起学生的学习的主动
期刊