随时随地的沟通，手机作为信息时代的产物，给人们生产生活方式带来了极大的变革。尤其是近几年，随着各种新技术、新应用不断的涌现，已经不仅仅局限于单纯的通话功能，人们可以通过手机进行电子银行交易、无线证券交易、无线网上购物等应用，手机已经慢慢演变成人们的娱乐平台、商务平台。然而，手机在带给人们方便的同时，个人隐私泄露、手机病毒等问题也对信息安全体系提出了严峻的挑战。手机的安全隐患越来越受到人们的关注，因此促进了新技术的发展，最新的手机指纹识别技术就是其中的佼佼者。指纹的唯一性和高安全性，使得指纹识别应用于手机成为可能，这样就大大地提高了手机应用的安全性，很好地保护了用户的个人隐私。本文首先介绍了指纹识别系统的组成部分，从指纹图像采集、指纹预处理、指纹特征提取、指纹匹配四个部分对系统的基本工作原理和相关算法加以详细说明。然后，基于Atrua Technologies公司提供的Atrua Wing方案，实现了指纹识别在MTK平台手机上的应用。本文主要阐述软件部分的设计，详细说明系统的应用程序接口和具体功能实现。另外，在原有算法的基础上提出了改进的指纹录入算法，对录入的模板增加了互相匹配的条件，保证了模板的正确性，提高了指纹模板的质量，为后续指纹认证的准确性提供更好的保障，实现整个系统的识别效率提高。最后研究指纹识别在手机上的应用研究，基于指纹的高安全性，提出了一种手机中结合指纹识别的数字签名方案，将指纹识别与数字签名融合，进一步提高安全性，并提出一种基于椭圆曲线的嵌入式时控代理签名。