在蛋白质二级结构形成过程中，邻近氨基酸的影响作用是不可忽略的。Chou-Fasman提出的二级结构构象因子并没有对邻近氨基酸的影响作用进行细致考虑。在Chou&Fasman工作基础之上，新的二级结构预测方法尽可能的将更多的影响因素考虑进来，并且在二级结构预测准确率上有了一定的突破。分析已有的预测方法，可以看出将蛋白质中每个残基单独进行考虑得到的预测结果是粗糙的。在这篇研究论文中，我们首先采用类似Chou-Fasman的方法，构建了包含邻位影响作用的构象因子和二肽二级结构构象因子，分析了邻位氨基酸对于二级结构倾向性的影响和二肽片段的二级结构倾向性。邻位构象因子和二肽构象因子对于我们理解氨基酸的二级结构倾向性有了一定的帮助。在这个基础上，我们将研究对象扩大到了多肽片段。分别研究了三肽、四肽、五肽和六肽片段的二级结构倾向性，并将多肽片段的二级结构倾向性尝试着应用于蛋白质二级结构预测。 经过研究，我们取得了以下结论： 1．将Chou-Fasman的构象因子扩展为包含邻位氨基酸影响作用的邻位因子，研究了邻位氨基酸对于二级结构倾向性的影响。在某些邻位氨基酸的影响下，二级结构倾向性会发生变化。并且N端邻位和C端邻位对于二级结构倾向性的影响并不完全相同。比较邻位因子的差异，可以看出邻位氨基酸对于二级结构倾向性影响的位置差异性。 2．二肽二级结构构象因子显示大部分具有强二级结构倾向性的氨基酸在二肽序列片段中仍然能保持二级结构倾向性。二肽二级结构构象因子对于一些二级结构倾向性不明显的氨基酸可能会有更好的预测。折叠二级结构在大多数亲水性氨基酸和疏水性氨基酸的排列顺序上有特殊要求。折叠二级结构的二肽构象因子在序列残基对调的时候，更易于出现倾向性的变化。 3．多肽片段蛋白质二级结构倾向性的研究，便于理解蛋白质多肽片段包含的结构因素与二级结构倾向性之间关系。不同长度的多肽序列片段可以采取不同的二级结构构象。随着片段长度的增加，多肽序列片段的二级结构倾向性表现得更加明显。利用多肽片段的二级结构倾向性对蛋白质二级结构构象进行预测，预测准确率很大程度上受到所选择的权重值的影响。而影响权重值反应的正是多肽片段长度对于二级结构倾向性的影响。