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本文采用ISSR分子标记技术,对课题组收集的百合属14个野生种和7个栽培品种的亲缘关系、岷江百合两个野生群体的遗传结构、百合和泸定百合的种内遗传多样性进行分析,主要结论如下:1、百合属14个野生种和7个栽培品种的亲缘关系从123条引物中筛选出15条引物,对14个野生种和7个栽培品种(21份材料)进行扩增,共检测到155个多态位点(PPN),多态谱带的比例(PPB)为98.10%,等位基因观察值(A)为1.9810,有效等位基因平均数(Ne)为1.5125,平均期望杂合度(He)为0.3156,Shannon多样性指数(I)为0.4841。聚类分析表明,21份材料基本上可分为两大类群,百合组属于第一类群,卷瓣组与栽培品种属于第二类群。栽培品种与卷瓣组亲缘关系较近,与百合组亲缘关系较远。麝香百合系列品种与百合、岷江百合亲缘关系较近,百合组与卷瓣组的部分种质均有可能参与了东方百合系列品种的形成,但东方百合与卷瓣组中的川百合、山丹关系和百合组的泸定百合亲缘关系较近,与百合、野百合亲缘关系较远;野生种的遗传多样性远远高于栽培品种。2、岷江百合两个野生群体遗传结构从123条引物中筛选出12条引物,对52个样品共扩增出63条多态性谱带(PPN),多态性谱带比例(PPB)为96.92%,等位基因观察值(A)为1.9692,有效等位基因平均数(Ne)为1.5572,平均期望杂合度(He)为0.3276,Shannon多样性指数(I)为0.4932;分子方差分析表明,82.43%的遗传差异存在于群体内,17.57%的遗传差异存在于群体间。结合个体间亲缘关系的UPGMA聚类图和空间位置分布图分析表明,大部分个体间的亲缘关系与空间位置距离分布存在较强的正相关性;两个群体间可能存在较强的基因交流,以种子或花粉为主要传播形式。本研究结果表明,植物的交配系统与生境的共同作用决定群体遗传结构。3、百合遗传多样性从123条引物中筛选出13条引物,对32个不同地理百合样品扩增,共检测到61个多态位点(PPN),多态谱带比例(PPB)为96.72%,等位基因观察值(A)为1.9672,有效等位基因平均数(Ne)为1.5425,平均期望杂合度(He)为0.3236,Shannon多样性指数(I)为0.4900。聚类和亲缘分析初步表明,个体间的亲缘关系与地理分布表现出相关性,并且与植株的抗性差异也存在一定的相关性。4、泸定百合遗传多样性从123条引物中筛选出12条引物,对34个泸定百合样品扩增,共检测到90个多态位点(PPN),多态性谱带比例(PPB)为96.72%,等位基因观察值(A)为2,有效等位基因平均数(Ne)为1.4698,平均期望杂合度(He)为0.2934,Shannon多样性指数(I)为0.4569;泸定百合种内表现出较高的遗传多样性,泸定百合微卫星重复序列的种类和频率要高于其