生态环境损害赔偿诉讼是赔偿权利人针对赔偿义务人因污染环境、破坏生态的行为造成生态环境类公共利益的损害而提起的诉讼。从设立目的角度分析,此类诉讼的本质应当是一种以保护环境利益为目的的诉讼。从实体法的角度出发,其与环境民事公益诉讼的基础应当相同,但不应当适用普通环境侵权诉讼的实体法;从程序法的角度而言,环境民事公益诉讼的大部分程序规则契合于此类诉讼,但其又有自己的独特价值。因此,生态环境损害赔偿诉讼是一类特殊的环境民事公益诉讼。本文主要按照“实践问题——理论——制度完善”的具体思路展开,一共分三个部分:第一部分研究现有的关于生态环境损害赔偿诉讼与环境民事公益诉讼衔接的案例。从两者衔接的司法实践中突显的问题入手,主要围绕主体资格、法律适用、诉权保障、支持起诉、分期履行五方面的问题与对策展开。第二部分从理论入手,论述生态环境损害赔偿诉讼的法律性质。并结合环境民事公益诉讼的法律规定,从实体法和程序法两方面论述其与环境民事公益诉讼的关系。第三部分主要对第一部分和第二部分进行归纳。围绕《最高人民法院关于审理生态环境损害赔偿案件的若干规定(试行)》的第十六至十八条可能存在的问题展开,并从宏观的角度为两者的衔接提出具体建议。以期从理论和实践角度为两者的衔接尽绵薄之力。