免疫相关基因在HIV/AIDS湿热内蕴证中的表达研究

来源 :河南中医药大学 河南中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dudu123abc
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目的:采用基因芯片技术检测HIV/AIDS湿热内蕴证免疫基因表达情况;筛选与HIV/AIDS湿热内蕴证免疫相关的mRNA;运用数据挖掘技术对发现的免疫mRNA进行数据分析,分析免疫相关mRNA的功能和信号通路,同时对HIV/AIDS湿热内蕴证免疫相关mRNA及信号通路进行相互关系的研究,探索免疫mRNA在HIV/AIDS湿热内蕴证中的分子机制,找到HIV/AIDS湿热内蕴证的特异性表达mRNA,为阐明艾滋病中医证候分子机制及艾滋病中医辨证治疗客观化提供实验依据和参考,为建立治疗艾滋病中医药研究平台提供技术支撑。  方法:⑴研究对象分为HIV/AIDS湿热内蕴证患者16例,健康对照组20例,均来自于河南省某地区。艾滋病湿热内蕴证患者采用国家卫生部2011年版《艾滋病诊疗指南》和本项目组前期国家级课题成果“HIV/AIDS常见证候诊断量表”为诊断标准。⑵采集患者和正常对照组的清晨空腹外周血作为研究样本,提取样本总RNA进行研究。应用Agilent基因表达谱芯片对mRNA表达检测,运用BRB-ArrayTools(Version4.1)软件,在Percent of data missing or filtered out exceeds50%,Percent of absent(i.e., Detection Call=A) data exceeds50%的标准下对各种基因芯片数据进行分析。⑶用人类免疫基因芯片筛选湿热内蕴证候免疫相关表达基因。按照 p<0.05,倍数差异FC>2或FC≤0.5标准筛选湿热内蕴组和健康对照组对比的免疫差异基因;②在线输入http://david.abcc.ncifcrf.gov/summary.jsp对本体功能进行分析;将筛选出的免疫差异基因输入KEGG数据库,找出特异性表达的免疫差异基因所涉及的信号通路并进行分析。应用网络工具STRING(http://string.embl.de),对特异性表达的差异基因进行相互关系分析。  结果:①运用SPSS21.0分析,两组在年龄、性别构成上没有显著差异。②筛选出两组对比的免疫相关差异基因77条,根据基因的本体功能,筛选出免疫反应过程相关差异基因20条。③在KEGG_PATHWAY数据库中找到HIV/AIDS湿热内蕴证免疫相关基因涉及的信号通路IL-17 signaling pathway有6条,TNF signaling pathway有6条,NF-kappa B signaling pathway有5条,Toll-like receptor signaling有5条,Pathways in cancer有5条等。④把HIV/AIDS湿热内蕴证中与免疫相关的特异性差异基因在线输入STRING在线分析,发现其中的13个基因彼此之间存在着紧密联系,它们组成了相互关系图,该图节点为20个,边为22个。  结论:⑴基因芯片技术能够得到HIV/AIDS中医证候的差异基因。⑵免疫差异基因IL-8、NF-κB、SOD2、TRIB1表达量的改变可能是引起艾滋病人免疫缺陷共同的作用机制,免疫基因SOD2和TRIB1为湿热内蕴证的特异性差异基因,可能在HIV/AIDS湿热内蕴证形成机制中起关键作用。⑶HIV/AIDS湿热内蕴证的免疫相关差异mRNA存在相互作用网络关系,提示这些基因相互调控,共同在HIV/AIDS湿热内蕴证的分子机制中发挥重要作用。
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