金针菇（Flammulina filiformis）是目前工厂化程度最高的食用菌种类,通常栽培规模较大,但病害一旦发生,极易大面积蔓延。金针菇病害发生与栽培环境中微生物浓度和种类密切相关。本研究采用了平板沉降法收集了金针菇工厂出菇房空间微生物,根据奥姆斯基公式计算了微生物的浓度,并采用形态观察及分子序列测定方法进行了种类鉴定。比较了5种消毒剂空间消毒效果,测定了它们对4种金针菇病原菌的抑制作用,对金针菇菌丝生长的影响,以及对出菇房常见金属材料的腐蚀性,主要研究了“过氧化氢-银离子”复合消毒剂的使用效果,检验了它对金针菇产量的影响,分析了药剂残留情况,为金针菇工厂科学选用空间消毒剂奠定基础。主要结果如下:1.在金针菇出菇房5个检测点中,靠近出菇房入口处3个检测点真菌和细菌浓度均高于其它2个点（P＜0.05）,其中正对出菇房入口的检测点真菌和细菌浓度最高。2.对金针菇出菇房空气中的微生物进行分离纯化和显微观察并进行16S r RNA测序（细菌）或ITS测序分析（真菌）。结果显示,细菌群落主要由Bacillus、Brevibacterium、Exiguobacterium等属组成,Bacillus和Staphylococcus是优势类群,分别占38.1%和23.8%;在细菌群落中检测到Pseudomonas的存在,Pseudomonas中部分成员是金针菇致病菌;真菌群落主要由Aspergillus、Acremonium、Chloridium等属组成,Aspergillus是优势类群,占21.4%。3.空间消毒试验结果显示,消毒剂B（4%含氯复合消毒剂）和C（7.9%过氧化氢-0.0058%银离子复合消毒剂）对真菌消杀作用显著高于消毒剂A1（36.5%二氯异氰尿酸钠）、A2（39%二氯异氰尿酸钠）和A3（44%二氯异氰尿酸钠）（P＜0.05）;消毒剂A1和C对细菌的消杀作用显著高于消毒剂A2（P＜0.05）,但与消毒剂A3和B无显著差异（P＞0.05）;在有效成分相同的A类消毒剂中,低浓度的A1对细菌消杀作用显著高于高浓度的A2,表明消毒剂的效果不仅与产品有效成分含量有关,还可能与产品其它性状有关。4.抑制试验结果显示,消毒剂C对4种金针菇病原菌Arthrobacter arilaitensi、Pseudomonas yamanorum、Pseudomonas migulae、Ewingella americana均具有良好的抑制作用,特别在对Arthrobacter arilaitensi的抑制试验中,消毒剂C在稀释至32倍的情况下仍具有显著的抑制作用;A1、A2和A3为同类别消毒剂,但A1的对4种病原菌的抑制作用显著优于A2和A3;消毒剂B对Ewingella americana的抑制作用显著优于对其它3种病原菌的抑制作用。5.安全性试验结果显示,5种消毒剂均对金针菇菌丝生长有抑制作用。消毒剂C对金针菇菌丝生长的影响显著低于消毒剂B（P＜0.05）,与消毒剂A1、A2、A3无显著差异（P＞0.05）;5种消毒剂对金属铜、铝以及不锈钢均有腐蚀作用,其中消毒剂C对3种金属的腐蚀性最小。6.采用消毒剂C处理不同生长阶段的金针菇,结果显示,在原基期和出芽期喷洒消毒剂金针菇产量显著低于对照组（P＜0.05）,在搔菌期喷洒消毒剂时金针菇产量与对照组无显著差别（P＞0.05）。在搔菌期喷洒消毒剂C,待金针菇子实体成熟后,取样进行药剂残留检测,结果显示银离子浓度未超标。搔菌期是金针菇最易感染病原物的时期,研究表明消毒剂C可应用于金针菇搔菌期空间消毒。