我国的三大诉讼法对法院整体回避都未予以明确规定,在现实司法实践中,发生法院整体回避事由时,一般是通过指定管辖来进行解决,从法律规定来看似乎可行,但是这建立在法院的自发自主的行动中,被告人作为诉讼活动的弱势一方,人权保障不足,也会极大的削弱法院的裁判权威。例如在王成忠民事枉法裁判一案中,当事人以其和法官之间是同事、朋友关系,可能影响案件审判的公正性,申请该法院整体回避,其申请权利没有在法律条文中予以明确规定而予以驳回,因此回避程序的启动全靠审理法院的自觉行动,从此处,笔者注意到被告人王成忠的申请权利可谓缺乏保障。本文就刑事诉讼中法院整体回避问题的基本内涵、问题的产生及所面临的现实困境进行了系统梳理,并在此基础上总结归纳出刑事诉讼中法院整体回避应当遵循的基本原则。同时,本文对外国法院整体回避展开了研讨,并进而框定刑事诉讼中法院整体回避应采取的方式,为我国刑事诉讼中法院整体回避勾勒出清晰、完整的框架。首先,本文厘清了刑事诉讼中法院整体回避的基本理论问题。在分析研讨了刑事诉讼回避制度概念、特征后,对刑事诉讼中法院整体回避的概念和特征进行了分析,从而使刑事诉讼中法院整体回避问题获得清晰的定位。其次,本文对刑事诉讼中法院整体回避与指定管辖进行比较,从而分析出刑事诉讼中法院整体回避的优势性。笔者认为,应当通过立法对刑事诉讼中法院整体回避的问题进行制度化、具体化,使其有据可依。笔者希望通过构造符合我国实际的法院整体回避,对刑事诉讼中法院整体回避的适用理念、回避的情形与运作程序、申请主体的权利保障、法院违反回避规定时的责任追究、现有刑事诉讼中回避制度与法院整体回避的衔接进行详细阐述,以期对司法实践能够有指导意义。