不同形态玉米日粮及日龄对鹅肠道微生物区系的影响

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鹅肠道微生物种群是一个非常复杂的微生态环境,对鹅的消化吸收及健康起着重要作用。本研究以扬州鹅为试验材料,采用PCR-DGGE技术研究不同形态玉米日粮及日龄对鹅肠道微生物区系的影响。选用7日龄扬州鹅192只,随机分成4组,每组4个重复,每个重复12只,F组全程饲喂粉状玉米日粮;F-L组8~28日龄饲喂粉状玉米日粮,29~84日龄饲喂整粒玉米日粮;L-F组8~28日龄饲喂整粒玉米日粮,29~84日龄饲喂粉状玉米日粮;L组全程饲喂整粒玉米日粮;四个处理组的营养水平一致。在28、49、70、84日龄时采集肠道内容物进行基因组总DNA的提取,利用细菌通用引物对细菌16S rRNA的V3区和V6-V8区进行PCR扩增,采用45%~60%的变性剂浓度范围对扩增产物进行DGGE,结合特异性和共性条带切胶回收DNA进行克隆测序并利用定量分析技术,分析比较了鹅肠道内容物菌群组成和细菌数量在28、49、70日龄这三个日龄的差异。另外,研究不同形态玉米日粮对84日龄扬州鹅肠道微生物区系的影响。结果显示:1、饲养后期鹅的肠道微生物区系受到饲养前期玉米形态的影响。2、整粒玉米日粮导致空肠菌群种类的下降和回肠细菌种类的增加,对十二指肠和盲肠微生物区系影响较小。即玉米日粮形态能够影响鹅肠道微生物菌群分布,其中,对空肠和回肠影响较大,对直肠的影响次之,对十二指肠和盲肠影响较小。推断整粒玉米日粮影响鹅肠道微生物区系可能归咎于整粒玉米日粮增加了食糜在消化道总的停留时间。3、饲喂整粒玉米日粮组的鹅肠道菌群种类减少,整粒玉米组鹅肠道细菌数量增加,即整粒玉米日粮能够减少鹅肠道菌群种类,提高细菌数量。4、随着日龄的增加,鹅肠道菌群种类减少,细菌数量的变化趋势是由低到高再到低的动态变化过程,即鹅肠道微生物的发育是一个动态变化过程。5、各肠道所有样品在PCR-DGGE图谱中主要优势条带都超过10条,其中盲肠的条带最多,加上亮度较低的条带,说明鹅肠道细菌种群结构和多样性非常丰富,肠道内含有如此丰富菌群是潜在的宝贵资源。6、分离所得的扬州鹅肠道优势菌条带序列比对与如下菌种同源性较高(达94%~100%):鸽肠球菌,链球菌,罗氏菌,金黄色葡萄球菌亚种,另外主要还是目前不可培养的菌种,这些高同源性的未知菌很可能是细菌种群中的新属或者新种,有待于以后进一步的研究。7、PCR-DGGE能够定性描述鹅肠道细菌种类的变化,是研究鹅肠道微生物多样性的一项非常有效的技术。但鉴于DGGE只能检测到优势菌群以及自身存在一定局限性,因此在以后的研究中应考虑其与其它方法,如传统微生物学方法或其它分子生物学技术结合使用,以便能更客观地从不同方面反映肠道微生物多样性信息。
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