几种园艺植物上发生的类病毒的种类鉴定及序列多样性分析

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:runqiusheng
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对采自北京、沈阳和新疆的67个葡萄样品,辽宁和新疆的5个苹果样品,北京的11个锦紫苏样品进行RNA抽提,斑点杂交、正反向电泳和RT-PCR检测。检测结果表明,(1)葡萄样品中,采自沈阳的7个样品(G59-G65)未检测到类病毒;北京的样品(G1-G58)中,41个样品啤酒花矮化类病毒(Hop stunt viroid,HSVd)阳性,29个样品葡萄黄痘类病毒(Grapevine yellow speckle viroid,GYSVd)阳性,其中23个样品同时检测到了HSVd和GYSVd;新疆样品(G66,G67)均检测到了HSVd、GYSVd,在新疆吐鲁番样品(G66)中检测到了澳大利亚葡萄类病毒(Australia grapevine viroid,AGVd);所有样品(G1-G67)均未检测到柑橘裂皮类病毒(Citrus exocortis viroid,CEVd)。(2)5个苹果样品中,A1,A3,A4带有苹果锈果类病毒(Apple scar skin viroid,ASSVd),其余均为健康植株。(3)采自北京的11株锦紫苏样品全部带有锦紫苏类病毒(Coleus blumei viroid,CBVd)。 对检测阳性的葡萄、苹果和锦紫苏样品的RNA进行克隆、测序和序列分析。结果表明,(1)AGVd、HSVd序列变异较小,GYSVd序列变异很大,在研究GYSVd过程中发现一种新的类病毒,命名为中国葡萄类病毒(Chinese grapevine viroid,CGVd),其与GYSVd1、GYSVd2同源性均小于90%。(2)苹果锈果类病毒辽宁分离物、新疆分离物和Puchta等报道的序列高度同源。(3)所得CBVd序列与GenBank中的报道序列进行比较,同源性为85.23%-99.20%。 本研究获得并登录了28条HSVd、18条GYSVd、7条CGVd、8条AGVd、3条ASSVd和5条CBVd1的全序列。HSVd、AGVd、GYSVd1、GYSVd2在中国均属首次报道。
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