猪LPL基因和A-FABP基因遗传变异研究

来源 :西北农林科技大学 西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhougtz
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猪的胴体瘦肉率和肉质品质是两项重要的经济性状,提高胴体瘦肉率的育种目标已取得一定进展,但肉质不断下降。我国地方猪种具有丰富的遗传多样性和优良的肉质品质,故今后的育种目标发展为以保持和合理利用我国地方猪种肉质优良的优势为前提,提高瘦肉率。而传统的育种手段很难使瘦肉率和肉质这两个呈负相关的性状同时提高,因此,随着现代分子育种技术脱颖而出,分子标记辅助选择成为一种可行的育种手段。候选基因法是研究动物数量性状遗传机制的主要方法之一,LPL基因和A-FABP基因分别被确定为影响背膘厚和肌内脂肪含量的主要候选基因。本研究选用3个国外猪种、4个中国地方猪种、1个培育品种和野猪共368头猪作为实验动物,利用PCR-RFLP技术和微卫星方法分别对脂蛋白脂酶(LPL)的第6、第8内含子和脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因第1内含子的微卫星序列进行了多态性分析,目的是发现新的多态性位点,为确定影响背膘厚和肌内脂肪含量的主效基因或有效的连锁标记奠定基础。主要研究结果如下:1在LPL基因第6内含子的SmaⅠ-RFLP位点上,大白猪、汉中白猪及野猪以BB型为主;长白、杜洛克和内江猪以AA和AB型为主;而荣昌猪和汉江黑猪以AB和BB型为主;基因型之间没有表现出明显的品种特征。2在LPL基因第6内含子的PvuⅡ-RFLP位点上,国外猪种均为DD纯合型,而国内猪种和野猪均存在变异;中国脂肪型猪种(除汉中白猪外)与国外瘦肉型猪种有明显的基因型差异,C等位基因可能与我国猪种高背膘厚相关。3在LPL基因第8内含子的EcoRⅠ-RFLP位点上,国外猪种和中国地方猪种均以EF基因型为主,F等位基因频率较高,没有明显的品种特征。4在LPL基因第8内含子的Hind Ⅲ-RFLP位点上,国外猪种和荣昌猪存在遗传变异,其余国内猪种和野猪均为FF纯合型。5在A-FABP基因第1内含子的微卫星位点上,共发现了16个等位基因,9种基因型。除汉中白猪没有EM基因型外,EM和GN基因型在各猪种中均有分布,且在大白猪、长白猪、杜洛克、荣昌猪和内江猪中占有优势。 <WP=7>6在A-FABP基因第1内含子的微卫星位点上,根据Chebychev遗传距离UPGMA法将8个家猪品种和1个野猪品种聚为3类:大白猪、长白猪和杜洛克为一类;荣昌猪、汉中白猪和内江猪为一类;八眉猪、野猪和汉江黑猪为一类。 7在LPL基因的4个PCR-RFLPs位点上,野猪的基因型分布、基因频率、杂合度和多态信息含量均与中国猪种一致。在A-FABP基因第1内含子的微卫星位点上,野猪的基因型分布、基因频率、遗传相似性和遗传距离也均与中国猪种相一致,说明本研究选用的野猪与中国地方猪种亲缘关系较近。
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