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放线菌在各个领域都有着广泛应用,尤其在医疗领域,放线菌是抗生素的重要来源。由于抗生素的广泛使用导致大量临床耐药菌的出现。嗜盐放线菌是一类极度耐受高盐环境的放线菌,为适应高盐环境而具备独特的生理机制,可能产生有价值的次级代谢产物。利用高通量测序技术对新疆地区艾丁湖、达坂城盐碱湖和乌尊布拉克28个样品放线菌资源进行研究,研究结果显示:艾丁湖主要由Solirubrobacterales 15.5%、Gaiellales 13.2%、Niteiliruptorales 10.61%、Frankiales 10.05%组成;达坂城盐碱湖主要由Niteiliruptorales 23.04%、Actinomarinales 21.73%、Micrococcales 12.33%、Microtrichcales 11.70%组成;乌尊布拉克主要由Euzebayales 42.19%、Frankiales18.48%、Corynebacteriales 13.3%组成。通过分类信息统计结果表明3个盐湖样对放线菌类群的覆盖度非常高;样本层级聚类分析表明3个盐湖样品之间具有明显差异。在纯培养分离过程中,利用新霉素排除嗜盐古菌的干扰及多孢放线菌属大多数对红霉素及红霉素类似物有抗性的生物学特性,建立抗生素选择性分离方法。可培养结果显示,分离得到放线菌有糖单胞菌属（Saccharomonospora）、嗜盐刺丝菌属（Haloechinothrix）、嗜盐多孢菌属（Halopolyspora）、高温双歧菌属（Thermobifida）、嗜盐生孢放线菌属（Haloactinospora）,其中纯培养分离得到2个候选新属、6个候选新种。实验结果表明新霉素对古菌有很好的抑制作用,并且分离得到的放线菌新类群概率较高,为盐湖放线菌类群分离方法提供了新思路。通过抗生素选择性分离得到一株嗜盐放线菌候选新属YIM S02039,并对其多相分类初步研究,初步确定是诺卡氏科（Nocardiopsaceae）的一个新属。本研究通过高通量测序对新疆地区3个盐湖群落组成及差异有了整体认识,揭示了3个盐湖放线菌资源的挖掘情况。对新疆地区3个盐湖放线菌资源纯培养分离过程中,仅仅考虑抗生素单个条件,分离到新物种的概率就有极大的提升,对其它地区嗜盐放线菌纯培养分离具有指导意义。