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背景:肝癌是全球常见的癌症,初期临床症状不明显,实验室和影像检出率低,早期诊断极为困难;另外其病情发展迅速、容易复发和转移,因此探寻相关发病机制和寻找早期灵敏的诊断标志物是目前肝癌研究的热点和难点。流行病学研究显示,过去十年中,肝癌所致的死亡人数明显上升,预计在接下来的十年中,其所带来的药物和经济方面的负担仍然会加重。临床研究公认,中晚期发生转移和术后复发是目前肝癌死亡率高居不下和5年生存率低的主要原因。众多研究显示,早诊断的肝癌病人术后5年生存率明显高于中晚期。当下,即使利用共识的早期筛查肝癌的主要方法,即影像超声联合实验室血清学检测,依然至少有30%的早期肝癌无法被检出。因此寻找癌前结节或者极早期癌症病变的研究需更多倾斜到利用灵敏度高的分子检测技术。事实上,本实验室和众多研究近年先后发现,各种癌症病人组织和血液中含有许多异常表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),其中,有相当一部分lncRNA参与调控肿瘤发生,侵袭和转移过程,具有作为标志物的潜质。本研究的目标是通过数据分析和相关临床及实验室研究,寻找与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)特异相关的lncRNA,评估其诊断和预后价值,以及探索其在HCC中的相关分子机制。
方法:首先,采用GEO数据库数据筛选候选基因,选定HCC组中相对于正常对照组显著上调的一个lncRNABCYRN1(brain cytoplasmic RNA 1),在通过多个在线数据库预测BCYRN1的靶标miRNA和mRNA后,取交集确定核心基因后富集相关通路并建立LncRNA—miRNA—mRNA网络;最后,通过实验验证BCYRN1的临床意义及相关转移机制,我们收集了73对HCC癌组织和癌旁组织;124例HCC、79例肝硬化(livercirrhosis,LC)、68例乙型病毒性肝炎(chronic hepatitis B,CHB)病人以及74例健康体检者(healthy control,HC)的血浆,评估BCYRN1的临床应用价值;通过建立BCYRN1过表达/敲降模型,寻找下游靶基因,探究BCYRN1对HCC细胞转移的影响。
结果:①对微阵列数据集GSE78160数据分析发现:14个lncRNA明显下调,123个lncRNA明显上调,其中BCYRN1是上调的lncRNA之一。②在线数据库工具预测分析提示,BCYRN1可能通过lncRNA–miRNA–mRNA网络调控某些癌症相关通路,并发挥促进HCC发生和转移的作用。③实验研究结果证明,HCC癌组织中BCYRN1表达上调(P<0.001),其上调的水平与肿瘤淋巴结转移(P=0.026)和预后差相关(P=0.0182);HCC血浆与LC血浆、HC血浆(P<0.001)之间,CHB血浆和HC血浆(P<0.05)、LC血浆(P<0.001)之间、LC血浆和HC血浆(P<0.001)之间BCYRN1的表达都具有统计学差异;血浆BCYRN1联合甲胎蛋白检测,可明显提高HCC检出率;BCYRN1可能通过调控RACI促进HCC细胞侵袭和迁移。
结论:我们的研究结果为探索HCC的病因和发生机制研究提供新的角度,同时发现BCYRN1有可能作为肝癌潜在的诊断和预后生物标志物。
方法:首先,采用GEO数据库数据筛选候选基因,选定HCC组中相对于正常对照组显著上调的一个lncRNABCYRN1(brain cytoplasmic RNA 1),在通过多个在线数据库预测BCYRN1的靶标miRNA和mRNA后,取交集确定核心基因后富集相关通路并建立LncRNA—miRNA—mRNA网络;最后,通过实验验证BCYRN1的临床意义及相关转移机制,我们收集了73对HCC癌组织和癌旁组织;124例HCC、79例肝硬化(livercirrhosis,LC)、68例乙型病毒性肝炎(chronic hepatitis B,CHB)病人以及74例健康体检者(healthy control,HC)的血浆,评估BCYRN1的临床应用价值;通过建立BCYRN1过表达/敲降模型,寻找下游靶基因,探究BCYRN1对HCC细胞转移的影响。
结果:①对微阵列数据集GSE78160数据分析发现:14个lncRNA明显下调,123个lncRNA明显上调,其中BCYRN1是上调的lncRNA之一。②在线数据库工具预测分析提示,BCYRN1可能通过lncRNA–miRNA–mRNA网络调控某些癌症相关通路,并发挥促进HCC发生和转移的作用。③实验研究结果证明,HCC癌组织中BCYRN1表达上调(P<0.001),其上调的水平与肿瘤淋巴结转移(P=0.026)和预后差相关(P=0.0182);HCC血浆与LC血浆、HC血浆(P<0.001)之间,CHB血浆和HC血浆(P<0.05)、LC血浆(P<0.001)之间、LC血浆和HC血浆(P<0.001)之间BCYRN1的表达都具有统计学差异;血浆BCYRN1联合甲胎蛋白检测,可明显提高HCC检出率;BCYRN1可能通过调控RACI促进HCC细胞侵袭和迁移。
结论:我们的研究结果为探索HCC的病因和发生机制研究提供新的角度,同时发现BCYRN1有可能作为肝癌潜在的诊断和预后生物标志物。