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云杉矮槲[寄生(Arceuthobium sichuanense)是一种多年生半寄生性种子植物,主要分布在我国西北地区的青海、甘肃,四川、西藏等地。近年来,这种病害已成为影响我国西北地区天然云杉林生长和繁育的重要病害之一,严重威胁到我国三江源地区植被健康与生态安全。为探究病害的发生原因,了解病害的遗传背景,从而进一步明确不同地理环境与寄主选择压力对云杉矮槲寄生发生发展的影响,本文采用ISSR(Inter simple sequence repeat)分子标记方法,对青海、甘肃、四川等地区5种寄主上的100份云杉矮槲寄生样本进行遗传多样性和遗传结构分析。主要研究结果如下:(1)利用筛选出的10条引物对100个云杉矮槲寄生样本的DNA进行扩增,共获得条带130个,分子量均在190-2800bp之间。不同引物扩增的条带数从8(UBC878)-20(UBC807)个不等,平均每个引物扩增数为13个。其中多态性条带共129个,多态性比例为99.23%。表明云杉矮槲寄生群体内部存在着较丰富的遗传变异。各群体多态性条带比例从30.77%-70.00%不等,10个群体多态性由高到低的顺序为:稻城(SDC)、互助(QHZ)、炉霍(SLH)、泽库(QZK)、门源(QMY)、道孚(SDF)、德格(SDG)、碌曲(GLQ)、夏河(GXH)、尖扎(QJZ)。(2)群体间和群体内的遗传多样性分析,能够了解云杉矮槲寄生在物种水平上的分化程度。通过POPGENE软件对十个来源群体的100份样本进行遗传多样性分析发现,各群体的多样性指数与多态位点百分率变化趋势基本一致,物种水平上的Nei’s遗传多样性指数(He)和Shannon信息指数(I)分别为0.3139和0.4765,高于各群体的平均值,表明云杉矮槲寄生物种水平的遗传多样性较高。群体内基因多样度(Hs)和群体间基因多样度(Dst=Ht-Hs)分别为0.1674与0.1582,说明群体内部的遗传变异(51.4%)更为丰富,同时群体间的基因流(Nm=0.5287)较弱,限制了群体间的基因交流。云杉矮槲寄生十个群体的遗传距离平均值为0.2279,遗传相似度平均值为0.799。德格与碌曲群体的遗传距离最大(0.3605),相似度(0.6974)最小,表明两个群体的差异明显。门源与互助群体的遗传距离最小(0.0528),相似度最大(0.9486),表明差异较小。(3)遗传距离的UPGMA聚类分析结果显示,当遗传相似系数为0.56时,100份样本可分为两大组:青海省、甘肃省的样本聚为第一组,四川样本聚为第二组。当相似系数为0.73时,第一组进一步细分为三个亚组:青海门源县(QMY)与互助县(QHZ)的样本聚为第一亚组,青海尖扎(QJZ)与泽库县(QZK)样本聚为第二亚组,甘肃省样本聚为第三亚组。当遗传相似系数为0.59时,可将第二组划分成两个亚组:采自道孚县(SDF)和炉霍县(SLH)的样本划分为一个亚组,德格县(SDG)与稻城县(SDC)的样本划分为另一个亚组。通过对100份云杉矮槲寄生样本进行距离聚类,能够清晰的呈现出各样本间亲缘关系的远近,表明云杉矮槲寄生各群体间存在有不同程度的遗传分化。(4)将所有100份云杉矮槲寄生样本按照寄主的不同分成五组,分别为:青海云杉组、青杆组、紫果云杉组、鳞皮云杉组和川西云杉组。分析各组间云杉矮槲寄生的遗传距离和遗传相似度发现,青海云杉组与紫果云杉组最为相似(相似度=0.9768),而青杆组和鳞皮云杉组的差异最为明显(遗传距离=0.2444)。鳞皮云杉组、川西云杉组与其他寄主组之间的遗传距离(0.1455-0.2444)均大于0.1,而青海云杉组、青杆组、紫果云杉组之间的遗传距离(0.0234-0.0703)均小于0.1,表明以鳞皮云杉和川西云杉为寄主的云杉矮槲寄生存在较为明显的遗传分化。按照寄主组间的聚类结果显示,寄生在青海云杉、紫果云杉和青杆上遗传相似度较高的云杉矮槲寄生(0.9321-0.9768)能够聚为第一类,而遗传相似度较低的鳞皮云杉组(0.7832-0.8027)和川西云杉组(0.8416-0.8646)则聚为第二类,表明不同寄主上云杉矮槲寄生存在着较明显的遗传分化。