潜伏感染期伪狂犬病病毒EPO基因甲基化状态分析

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伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)是一种具有神经嗜性的α型疱疹病毒,能在宿主体内建立持久潜伏感染。猪是PRV的原发感染宿主,阻止PRV建立潜伏感染和清除体内潜伏感染的病毒对于控制和根除伪狂犬病(Pseudorabies,PR)具有至关重要的作用。目前PRV建立潜伏感染的机理还不清楚。DNA甲基化在调控病毒基因组转录以及逃避宿主对寄生成分的限制和免疫系统监视中起作用,DNA甲基化在PRV建立和维持潜伏感染状态中的作用尚未知。2012年伊始,PR在河南省部分地区再次暴发。为探寻其中缘由,并为后期研究提供可靠试验材料,对2012年3月至2013年6月间采集的疑似PR病料接种Vero细胞并经gE-PCR扩增,分离鉴定出4株PRV毒株,同时对该4株病毒的gE、TK和gD基因进行克隆、测序及分析。序列分析显示,与参考毒株相比,4株PRV河南分离株的gE、TK、gD基因某些核苷酸及氨基酸发生突变。遗传进化分析显示,4株PRV河南分离株形成一个独立的小亚群,与中国其他地区2013年分离株亲缘关系密切,与2013年前分离株的亲缘关系较近,与欧洲、南美洲分离株的亲缘关系较远,推测此4株河南分离株是国内新型流行株。用分离鉴定的PRV流行毒株感染试验仔猪,复制PRV在宿主体内潜伏感染建立与维持的过程,并在DNA和RNA水平上检测IE180、EP0、LAT和gD基因的转录情况。结果显示,病毒在宿主体内潜伏后,LAT基因持续转录,而IE180、EP0和gD基因的转录停止,证明PRV猪潜伏感染模型建立成功,为进一步研究PRV乃至α-疱疹病毒潜伏感染机理提供可靠的实验材料和数据。为确定DNA甲基化在PRV潜伏感染期EP0基因启动子区的分布情况,在对该基因启动子区CpG岛及相关转录因子预测的基础上,应用硫化测序PCR方法检测潜伏感染期EP0基因启动子区甲基化状态。结果表明,在该基因启动子区存在零星分散的甲基化位点,但这些散在的甲基化位点并不属于对“GC”盒敏感的转录因子结合位点处,初步表明潜伏感染期PRV EP0基因启动子区DNA甲基化可能未对该基因的转录起调控作用,为进一步研究DNA甲基化在PRV潜伏感染建立中的作用奠定基础。
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