随着科技进步的发展，科研经费的投入比例与日俱增。但与此同时，科研经费在管理上存在很多的问题，违反科研经费管理规定的问题屡屡发生。为了科技的发展，科研工作的顺利开展，科研经费的管理工作变得更为重要，为了使科研经费的使用效率最大化，科研经费的预算管理成为了目前的研究热点。
　　本文以ZB研究所为例，结合全面预算管理理论、课题制管理、绩效预算管理等相关理论知识，针对ZB研究所的实际特点，构建了一套基于全面预算的管理体系。将全面预算管理在事前、事中、事后贯穿于这个预算管理体系中。深入探讨了ZB研究所在预算编制、预算执行、预算评价和预算绩效管理中的具体预算管理实施细则，从而使预算管理更高效、更合理、更有针对性。此外，本文还对目前科研经费的预算管理提出了有效的建议，为探索科研经费全面预算管理提供新的思路。