自从1994年我国分税制改革以来,增值税就成为我国税制结构中的主体税种。由于增值税实行凭增值税专用发票注明税金和其他增值税扣税凭证进行抵扣的计税方法,因此增值税专用发票和“人民币”相比,有时更具有价值。巨大的利益诱惑使犯罪分子铤而走险,疯狂虚开增值税专用发票,导致国家税款大量流失,并引发一系列问题。如何预防与治理虚开增值税专用发票,是一个亟需解决的问题,本文就是基于这样的研究背景撰写的。本文首先从税收和法律的角度给出了增值税专用发票及虚开增值税专用发票的概念；从税务及司法角度介绍了对虚开增值税专用发票的处理。再对虚开增值税专用发票的现状进行叙述,分析虚开行为的主要危害是侵害了课税税基、骗取国家出口退税、破坏经济金融秩序、影响国家形象,指出虚开增值税专用发票的成因关键是利益驱动,增值税制度上的漏洞也是虚开增值税专用发票的重要原因,并对虚开行为的特点进行了阐述。然后结合南京市石化企业系列虚开增值税专用发票案件及南京市DWDF服装有限公司虚开案件的典型案例,分析案件来源、查处过程、案件特点、作案手段,思考案件带来的启示；评价南京市现有预防与治理虚开增值税专用发票的措施及工作中存在的问题；再介绍了国内外先进经验和成功做法,然后引入协同治理理念,指出必须以政府为主导,组织协调税务等公共部门和其他非公共组织,发动全社会力量,建立协同治理主体体系和制度体系,以达到为南京市有效预防与治理虚开增值税专用发票提供对策的研究目的。预防与治理虚开是一项内容复杂、规模宏大的系统工程,政府等公共部门必须参与其中,结合公共管理理论进行研究具有一定意义,笔者引入协同治理理念,为解决南京市的实际问题提供了新的理论支持和观点。而且本文在理论研究的基础上,以南京市为研究对象,利用典型案例进行实证分析,在研究对象的选择方面有一定创新,并使本文的研究成果能够建立在现实基础之上,对实际工作具有一定的指导意义。